Stargazer和gam - 如何包含整个摘要输出?

时间:2013-06-14 08:56:19

标签: r latex stargazer

当使用平滑样条拟合广义加法模型时,只返回主效应,而不是summary(pros.gam)中可以看到的平滑项。观星者还可以归还这些吗?或者是否有其他功能或包可以完成这项工作?

library(ElemStatLearn)
library(mgcv)
library(stargazer)

pros.gam=gam(lpsa~s(lcavol)+s(lweight)+s(age)+s(lbph)+svi
+s(lcp)+gleason+s(pgg45),data=prostate)

summary(pros.gam) # Table should include the smooth terms that are visible here
stargazer(pros.gam,summary=TRUE)

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

toLatex包的

utils完成了这项工作:

require(utils)
toLatex(summary(pros.gam)$s.table) 

输出:

# \begin{tabular}{lD{.}{.}{7}D{.}{.}{7}D{.}{.}{7}D{.}{.}{7}}
# \toprule
 # & \multicolumn{1}{c}{edf} & \multicolumn{1}{c}{Ref.df} & \multicolumn{1}{c}{F} & \multicolumn{1}{c}{p-value} \\
# \midrule
# s(lcavol) & 1.0000000 & 1.0000000 & 48.8654347 & 0.0000000 \\
# s(lweight) & 7.4334733 & 8.3759397 & 2.9521585 & 0.0054553 \\
# s(age) & 1.7609527 & 2.1888342 & 3.2466098 & 0.0402275 \\
# s(lbph) & 1.7480193 & 2.1293872 & 2.3329425 & 0.0998080 \\
# s(lcp) & 3.3087460 & 4.0189658 & 1.3792509 & 0.2484695 \\
# s(pgg45) & 1.1277962 & 1.2388741 & 0.2681440 & 0.6563885 \\
# \bottomrule
# \end{tabular}

答案 1 :(得分:1)

我在转换GAM模型(mgcv包)的输出方面遇到同样的问题,我得到了我想要的" itsadug"由R. Harald Baayen撰写的包。

将模型摘要转换为针对knitr / R Markdown报告的Latex / HTML表格。

data(simdat)

具有随机效应和交互的模型:

m1 <- bam(Y ~ Group+te(Time, Trial, by=Group),data=simdat)
summary(m1)
gamtabs(m1, caption='Summary of m1')

有关更多示例,请参阅:

vignette("inspect", package="itsadug")