Permutational MANOVA

Question

我需要对我拥有的数据进行非参数检验，特别是r中的非参数版MANOVA。有谁知道如何能够在R中执行非参数测试，特别是编码是什么，以及使用什么包？谢谢！

Answer 1

尝试

install.packages("sos")
library("sos")
findFn("nonparametric anova")

然后，您可以阅读将要显示的一些帮助页面。他们中的一些人可能会做manova（搜索'nonparametric manova'只返回一次）。

Answer 2

Permutational MANOVA

require(vegan)
?adonis

Answer 3

这是我发现的，对某些随机生成的数据使用adonis中的vegan函数：

dframetest <- data.frame(X = rnorm(20), Y = rnorm(20), Z = rnorm(20), Label = c(rep("A",10),rep("B",10)))

adonis(dframetest[,1:3] ~ Label, permutations = 1000, data = dframetest, method = "euclidean")

输出看起来像这样：

Call:
adonis(formula = dframetest[, 1:3] ~ Label, data = dframetest,      permutations = 1000, method = "euclidean") 

Permutation: free
Number of permutations: 1000

Terms added sequentially (first to last)

          Df SumsOfSqs MeanSqs F.Model      R2 Pr(>F)
Label      1     1.747  1.7467 0.58834 0.03165 0.6334
Residuals 18    53.438  2.9688         0.96835       
Total     19    55.184                 1.00000

我当然更改了参数以适合我自己的数据，但这是一个很好的例子

请记住，此测试在数据的排列上运行（因为它是非参数测试，不能没有它就不能运行）

信用应该从@antsushi转到这个问题：Why does adonis() from vegan returns a different p-value every time it is?

R中的非参数MANOVA

3 个答案:

Permutational MANOVA