Question

我正在尝试在Cloudera的hadoop发行版上运行rhadoop（我不记得它的CDH3或4），并且遇到了一个问题：Rstudio服务器似乎无法识别我的全局变量。

在我的/etc/profile.d/r.sh文件中，我有：

export HADOOP_HOME=/usr/lib/hadoop
export HADOOP_CONF=/usr/hadoop/conf
export HADOOP_CMD=/usr/bin/hadoop
export HADOOP_STREAMING=/usr/lib/hadoop-mapreduce/

当我从终端运行R时，我得到：

> Sys.getenv("HADOOP_CMD")
[1] "usr/bin/hadoop"

但是当我运行Rstudio服务器时：

> Sys.getenv("HADOOP_CMD")
[1] ""

结果，当我尝试运行rhdfs时：

> library("rJava", lib.loc="/home/cloudera/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/2.15")
> library("rhdfs", lib.loc="/home/cloudera/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/2.15")
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rhdfs', details: 
    call: fun(libname, pkgname)
    error: Environment variable HADOOP_CMD must be set before loading package rhdfs
Error: package/namespace load failed for 'rhdfs'

有没有人知道如果不在特定的r.sh文件中我应该把我的环境变量放在哪里？

谢谢！

Answer 1

您应该在.Renviron或Renviron.site中设置环境变量。我认为这些文件是在R_HOME/etc/Renviron.site下定义的。您可以输入以下内容获取更多信息：

> ?Startup

有人遇到类似的问题here，这就是他解决问题的方法。

Answer 2

请注意，在Windows上，R在/Users/<name>/Documents中查找.Renviron文件，而RStudio似乎期望.Renviron文件位于/Users/<name>/。

Answer 3

您应该在Rstudio中设置环境变量，如

Sys.setenv（＆＃34; / hadoop路径＆＃34;）

然后你试试这个

Rstudio-server环境变量没有加载？

3 个答案: