knitr_child在升级到R 3.0后抛出错误

时间:2013-05-30 04:09:46

标签: r knitr sweave

一个已经无缝运行一个月以上的脚本在升级到R 3.0.1之后停止将我的子Latex代码添加到我的主文档中。以下代码段用于包含主文档中已编译的test.rnw文件中的文本(以便可以将其编译为一个文档)。现在它只包含已编译的rnw文件的文件名。

<<run-all, include=FALSE>>=
    out = NULL
    for (i in 1:10) {
      out = c(out, knit_child('test.rnw', sprintf('test-template-%d.tex', i)))
    }
@

\Sexpr{paste(out, collapse = '\n')}

当我尝试以交互方式运行knit_child命令时,我收到此错误:

> knit_child('test.rnw', sprintf('test-template-%d.tex', i))
Error in setwd(opts_knit$get("output.dir")) : character argument expected

单独运行knit()将编译Latex代码,如果我然后运行knin_child()没有错误,但“out”对象只包含子文件的文件名而不是内容。

任何想法如何解决这个问题?

1 个答案:

答案 0 :(得分:8)

您不应该以交互方式使用knit_child()。它被设计为在 knit()内被称为

如您所知,如果您未提供第二个参数,knit_child()的最新版本中的knitr将返回子文档的内容。通过显式提供第二个参数sprintf('test-template-%d.tex', i),您的意思是“请将输出写入此文件并返回文件名”。

要解决此问题,您需要删除第二个参数:

<<run-all, include=FALSE>>=
    out = NULL
    for (i in 1:10) {
      out = c(out, knit_child('test.rnw'))
    }
@

\Sexpr{paste(out, collapse = '\n')}