Question

所以我在Windows 8上，我正在为我的研究做一些图像分析。它需要运行这个名为“calculate_distances.py”的python脚本（我没有写它）。我也使用CellTool（http://pantheon.yale.edu/~zp2/Celltool/）和我已成功安装的Numpy。

当我尝试运行我的calculate_distances脚本时，我收到此错误：

Traceback (most recent call last):
file "calculate_distances.py" line 4, in <module>
import celltool.simple_interface as si
ImportError: No module named celltool.simple_interface

这是我的calculate_distances.py脚本：

#!/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.5/bin/python
# Import various celltool modules

import celltool.simple_interface as si
import celltool.contour.contour_class as contour_class
from celltool.utility.path import path
import celltool.utility.datafile as datafile
import numpy

# Designate your working directory - ie, replace '/parent_directory/' with the path that contains your contour files
#parent_dir=path('/parent_directory/')
parent_dir=path('./')

# Identify and load  all of the contour files
contour_files=parent_dir.files('*.contour')
contours=si.load_contours(contour_files)
all_distances=numpy.arange(len(contours[0].points))

# Calculate the normal displacement of the cell boundary at every contour point.
n=1
while n<len(contours):
contour_class.Contour.global_reorder_points(contours[n],contours[n-1])
displacement_vectors = contours[n-1].points - contours[n].points
normals = contours[n-1].inward_normals()
distances  = (normals * displacement_vectors).sum(axis=1)
all_distances=numpy.vstack((all_distances,distances))
n=n+1

# Save a csv file with the normal displacement of the boundary at each contour point (columns) at each time point (rows)
datafile.write_data_file(all_distances,parent_dir/'distances.csv')

我不知道这个错误意味着什么，因为我是第一个程序员。首先我认为我需要安装一个C ++ / fortran编译器，所以我安装了Simple Fortran，但它仍然不起作用。一切正常在Mac系统上运行（在我安装GNU fortran之后）但由于某种原因它不适用于Windows。是因为我的CellTool没有安装在正确的位置吗？或者是脚本的东西？

有什么想法吗？非常感谢您的帮助！！

Answer 1

那么你有两个选择。

尝试将CellTool安装目录添加到PYTHONPATH环境变量中（如果您尚未创建此变量）。搜索celltool.dll或libcelltool.dll（甚至celltool.py）之类的东西。看看它是否有帮助。如果不是：
按照以下几个步骤编译源代码...安装MinGW（安装程序here），安装程序询问时检查C / C ++（gcc / g ++）和Fortran。然后将C:/MinGW/bin（或安装MinGW的时候）添加到PATH环境变量中。从网站下载并解压缩CellTool源包。最后打开命令shell（搜索cmd程序），将目录更改为新解压缩的目录，然后输入：

python setup.py install

这应该正确编译并将celltool python包安装到Python安装的site-packages目录中。选项2是确保/安全（但不是最简单，我同意）的方式来实现它。

Python脚本ImportError：没有名为celltool.simple_interface的模块

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