Question

我需要编写一个python脚本，我需要在其中调用一些awk命令。

#!/usr/bin/python
import os, sys
input_dir = '/home/abc/data'

os.chdir(input_dir)
#wd=os.getcwd()
#print wd
os.system ("tail -n+2 ./*/*.tsv|cat|awk 'BEGIN{FS="\t"};{split($10,arr,"-")}{print arr[1]}'|sort|uniq -c")

它在第8行给出错误：SyntaxError：行继续符后的意外字符

有没有办法让awk命令在python脚本中运行？感谢

Answer 1

你在这个字符串中有两种类型的引号，所以在整个事物中使用三引号

>>> x = '''tail -n+2 ./*/*.tsv|cat|awk 'BEGIN{FS="\t"};{split($10,arr,"-")}{print arr[1]}'|sort|uniq -c'''
>>> x
'tail -n+2 ./*/*.tsv|cat|awk \'BEGIN{FS="\t"};{split($10,arr,"-")}{print arr[1]}\'|sort|uniq -c'

Answer 2

您应该使用subprocess代替os.system：

import subprocess
COMMAND = "tail -n+2 ./*/*.tsv|cat|awk 'BEGIN{FS=\"\t\"};{split($10,arr,\"-\")}{print arr[1]}'|sort|uniq -c"  

subprocess.call(COMMAND, shell=True)

正如TehTris指出的那样，问题中引号的排列将命令字符串分成多个字符串。预先格式化命令并转义双引号可以解决这个问题。

python脚本中的awk命令

2 个答案: