我从4 df收集数据,并希望通过rownames合并它们。我正在寻找一种有效的方法来做到这一点。这是我拥有的数据的简化版本。
df1 <- data.frame(N= sample(seq(9, 27, 0.5), 40, replace= T),
P= sample(seq(0.3, 4, 0.1), 40, replace= T),
C= sample(seq(400, 500, 1), 40, replace= T))
df2 <- data.frame(origin= sample(c("A", "B", "C", "D", "E"), 40,
replace= T),
foo1= sample(c(T, F), 40, replace= T),
X= sample(seq(145600, 148300, 100), 40, replace= T),
Y= sample(seq(349800, 398600, 100), 40, replace= T))
df3 <- matrix(sample(seq(0, 1, 0.01), 40), 40, 100)
df4 <- matrix(sample(seq(0, 1, 0.01), 40), 40, 100)
rownames(df1) <- paste("P", sprintf("%02d", c(1:40)), sep= "")
rownames(df2) <- rownames(df1)
rownames(df3) <- rownames(df1)
rownames(df4) <- rownames(df1)
这就是我通常会做的事情:
# merge df1 and df2
dat <- merge(df1, df2, by= "row.names", all.x= F, all.y= F) #merge
rownames(dat) <- dat$Row.names #reset rownames
dat$Row.names <- NULL #remove added rownames col
# merge dat and df3
dat <- merge(dat, df3, by= "row.names", all.x= F, all.y= F) #merge
rownames(dat) <- dat$Row.names #reset rownames
dat$Row.names <- NULL #remove added rownames col
# merge dat and df4
dat <- merge(dat, df4, by= "row.names", all.x= F, all.y= F) #merge
rownames(dat) <- dat$Row.names #reset rownames
dat$Row.names <- NULL #remove added rownames col
如您所见,这需要大量代码。我的问题是,如果用更简单的方法可以实现相同的结果。我尝试过(没有成功):更新:现在可以了!
MyMerge <- function(x, y){
df <- merge(x, y, by= "row.names", all.x= F, all.y= F)
rownames(df) <- df$Row.names
df$Row.names <- NULL
return(df)
}
dat <- Reduce(MyMerge, list(df1, df2, df3, df4))
提前感谢任何建议
答案 0 :(得分:40)
join_all
的 plyr
可能会做你想要的。但它们都必须是数据框,并且将rownames添加为列
require(plyr)
df3 <- data.frame(df3)
df4 <- data.frame(df4)
df1$rn <- rownames(df1)
df2$rn <- rownames(df2)
df3$rn <- rownames(df3)
df4$rn <- rownames(df4)
df <- join_all(list(df1,df2,df3,df4), by = 'rn', type = 'full')
即使rownames变化且不匹配, type
参数也应该有所帮助
如果你不想要rownames:
df$rn <- NULL
答案 1 :(得分:11)
编辑你的功能,我想出了一个功能,它允许你通过特定的列键(列的名称)合并更多的数据帧。结果数据框包含合并数据帧的所有变量(如果您只想保留公共变量(不包括NA,请使用:all.x= FALSE, all.y= FALSE
)
MyMerge <- function(x, y){
df <- merge(x, y, by= "name of the common column", all.x= TRUE, all.y= TRUE)
return(df)
}
new.df <- Reduce(MyMerge, list(df1, df2, df3, df4))
答案 2 :(得分:7)
我一直在寻找相同的功能。在这里和其他地方尝试了几个选项之后。对我来说最简单的是:
cbind.data.frame(df1,df2,df3,df4 ....)
答案 3 :(得分:6)
三行代码会给你完全相同的结果:
dat2 <- cbind(df1, df2, df3, df4)
colnames(dat2)[-(1:7)] <- paste(paste('V', rep(1:100, 2),sep = ''),
rep(c('x', 'y'), each = 100), sep = c('.'))
all.equal(dat,dat2)
啊,我明白了,现在我明白为什么你会陷入如此多的痛苦之中。使用旧的for
循环肯定可以解决问题。也许还有更聪明的解决方案
rn <- rownames(df1)
l <- list(df1, df2, df3, df4)
dat <- l[[1]]
for(i in 2:length(l)) {
dat <- merge(dat, l[[i]], by= "row.names", all.x= F, all.y= F) [,-1]
rownames(dat) <- rn
}