我用Rcpp和C ++为R编写了一些代码,试图让它更熟悉它:
#include <Rcpp.h>
#include <vector>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
CharacterMatrix reduce_sequences(CharacterMatrix completeDNA)
{
std::vector<int> informativeSites;
for(int i = 0; i < completeDNA.ncol(); i++)
{
CharacterVector bpsite(completeDNA.nrow());
for(int n = 0; n < completeDNA.nrow(); n++)
{
bpsite[n] = completeDNA(n,i);
}
if(any(bpsite != bpsite[0]).is_true()) informativeSites.push_back(i);
}
CharacterMatrix cutDNA(3, informativeSites.size());
for(int i = 0; i < informativeSites.size(); i++)
{
for(int n = 0; n < cutDNA.nrow(); n++)
{
cutDNA(n,i) = completeDNA(n,informativeSites[i]);
}
}
return cutDNA;
}
但是我得到了一个补丁错误,但不是来自我的源文件,而是来自Comparator_With_One_Value.h:
我不会假装完全理解这些错误,因为我仍处于C ++的初期阶段,但通过适当地评论我的代码并找到导致它的原因,这是我的第17行:
if(any(bpsite != bpsite[0]).is_true()) informativeSites.push_back(i);
我认为这与我使用any()有关。我做错了什么?
编辑:更改了行以反映上述解决的所有问题,除了两个: 控制台输出:
Error in Rcpp::sourceCpp("reduceseq.cpp") :
Error 1 occurred building shared library.
Comparator_With_One_Value.h返回的问题
operands to ?: have different types 'SEXPREC*' and 'int'
和
invalid conversion from 'SEXPREC* const' to 'int'
谢谢, 本。
答案 0 :(得分:2)
由于R
TRUE
,FALSE
,NA
中的3个逻辑值,我们会故意阻止这种情况。您应该可以像这样使用is_true
:
if(any(bpsite != bpsite[0]).is_true()) informativeSites.push_back(i);