使用nditer进行Numpy数组比较

时间:2013-05-14 19:45:28

标签: python arrays numpy iteration

下面的代码给出了正确的答案,但仅在数组(planmeas)相对较小时才有效。当我尝试在阵列上运行时,我实际上需要比较(每个300x300),它需要永远(我不知道多久,因为我在45分钟后终止它。)我想只迭代一个范围被评估的索引周围的数组值(p)。我试图在nditer标志'ranged'上找到文档,但无法找到如何实现特定范围来迭代。

p = np.nditer(plan, flags = ['multi_index','common_dtype'])
while not p.finished:
    gam_store = 100.0
    m = np.nditer(meas, flags = ['multi_index','common_dtype'])
    while not m.finished:
        dis_eval = np.sqrt(np.absolute(p.multi_index[0]-m.multi_index[0])**2 + np.absolute(p.multi_index[1]-m.multi_index[1])**2)           
        if dis_eval <= 6.0:
            a = (np.absolute(p[0] - m[0]) / maxdose) **2
            b = (dis_eval / gam_dist) **2
            gam_eval = np.sqrt(a + b)
            if gam_eval < gam_store:
                gam_store = gam_eval
        m.iternext()    
    gamma = np.insert(gamma, location, gam_store, 0)
    location = location + 1
    p.iternext()

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

如果您只想迭代数组的一小部分,我认为(除非我误解了这个问题)你应该从数组的一个片段创建一个nditer实例。

假设您只希望数组靠近(i,j),然后从此开始:

w = 5    # half-size of the window around i, j
p = np.nditer(plan[i-w:i+w, j-w:j+w], flags=...)

这是有效的,因为,说

a = array([[ 0,  1,  2,  3,  4],
           [ 5,  6,  7,  8,  9],
           [10, 11, 12, 13, 14],
           [15, 16, 17, 18, 19],
           [20, 21, 22, 23, 24]])

然后,

w = 1
i, j = 2,2
print a[i-w:i+w+1, j-w:j+w+1]
#array([[ 6,  7,  8],
#       [11, 12, 13],
#       [16, 17, 18]])