Fortran通过f2py扩展到Python：如何配置？

Question

我正在使用通过f2py（Ver.2）编译的Fortran（gfortran 4.4.7）编写的Python（2.7.2）扩展。

我可以使用cProfile来分析Python部分，但结果不会提供有关Fortran函数的任何信息。相反，时间归因于调用Fortran函数的Python函数。

我为我构建的所有Fortran对象启用了“-pg -O”标志，并在f2py调用中通过以下方式启用了共享对象：f2py --opt="-pg -O" ...

有关如何获取Fortran信息的任何提示都非常受欢迎。

如果有人使用类似的设置，使用不同的探查器，我也会感兴趣。

Answer 1

查看python扩展分析器yep。

Answer 2

Fortran函数调用显示为：

<ipython-input-51-f4bf36c6a947>:84(<module>). 

我知道，你无法识别被调用的模块，但至少这会给你一个想法。

另一种方法是将它包装到Python函数中，然后查看Python函数的时间。

Answer 3

此工作流程似乎运作良好：

• 1. 使用 callgrind 来分析您的代码（这会生成一个像callgrind.out.27237这样的文件）：

  

valgrind --tool = callgrind python my_python_script_calling_f2py_functions.py arg1 arg2

• 1. 转换为 .dot文件（如果需要，您可以安装gprof2dot：“pip install git + https://github.com/jrfonseca/gprof2dot”）

  

gprof2dot -f callgrind callgrind.out.27237＆gt; callgrind.dot

• 1. 使用graphviz创建图表（请参阅此stackoverflow问题Interpreting callgrind data）：

  

dot -Tjpg callgrind.dot -o callgrind.jpg