Question

在聪明的lapply之后，我留下了一个二维矩阵列表。

例如：

set.seed(1)
test <- replicate( 5,  matrix(runif(25),ncol=5), simplify=FALSE )
> test
[[1]]
          [,1]       [,2]      [,3]      [,4]      [,5]
[1,] 0.8357088 0.29589546 0.9994045 0.2862853 0.6973738
[2,] 0.2377494 0.14704832 0.0348748 0.7377974 0.6414624
[3,] 0.3539861 0.70399206 0.3383913 0.8340543 0.6439229
[4,] 0.8568854 0.10380669 0.9150638 0.3142708 0.9778534
[5,] 0.8537634 0.03372777 0.6172353 0.4925665 0.4147353

[[2]]
          [,1]      [,2]      [,3]      [,4]      [,5]
[1,] 0.1194048 0.9833502 0.9674695 0.6687715 0.1928159
[2,] 0.5260297 0.3883191 0.5150718 0.4189159 0.8967387
[3,] 0.2250734 0.2292448 0.1630703 0.3233450 0.3081196
[4,] 0.4864118 0.6232975 0.6219023 0.8352553 0.3633005
[5,] 0.3702148 0.1365402 0.9859542 0.1438170 0.7839465

[[3]]
...

我想把它变成一个三维数组：

set.seed(1)
replicate( 5,  matrix(runif(25),ncol=5) )

显然，如果我正在使用复制，我可以打开simplify，但sapply不能正确简化结果，stack完全失败。 do.call(rbind,mylist)将其转换为2d矩阵而不是3d数组。

我可以通过循环执行此操作，但我正在寻找一种简洁实用的方法来处理它。

我最接近的方式是：

array( do.call( c, test ), dim=c(dim(test[[1]]),length(test)) )

但我觉得这样做不够优雅（因为它反汇编然后重新组合了矢量的数组属性，并且需要进行大量测试以确保安全（例如每个元素的尺寸相同）。

Answer 1

试试这个：

simplify2array(test)

Answer 2

您可以使用abind包，然后使用abind(test, along = 3)

library(abind)
testArray <- abind(test, along = 3)

或者您可以在调用simplify = 'array'时使用sapply，而不是lapply。 simplify = 'array'与simplify = TRUE不同，因为它会更改higher

中的参数simplify2array

例如

foo <- function(x) matrix(1:10, ncol = 5)
# the default is simplify = TRUE
sapply(1:5, foo)
      [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
 [1,]    1    1    1    1    1
 [2,]    2    2    2    2    2
 [3,]    3    3    3    3    3
 [4,]    4    4    4    4    4
 [5,]    5    5    5    5    5
 [6,]    6    6    6    6    6
 [7,]    7    7    7    7    7
 [8,]    8    8    8    8    8
 [9,]    9    9    9    9    9
[10,]   10   10   10   10   10
# which is *not* what you want
# so set `simplify = 'array'
sapply(1:5, foo, simplify = 'array')
, , 1

     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    3    5    7    9
[2,]    2    4    6    8   10

, , 2

     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    3    5    7    9
[2,]    2    4    6    8   10

, , 3

     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    3    5    7    9
[2,]    2    4    6    8   10

, , 4

     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    3    5    7    9
[2,]    2    4    6    8   10

, , 5

     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    3    5    7    9
[2,]    2    4    6    8   10

Answer 3

test2 <- unlist(test)
dim(test2) <- c(dim(test[[1]]),5)

或者如果您事先不知道预期的尺寸：

dim3 <- c(dim(test[[1]]), length(test2)/prod(dim(test[[1]])))
dim(test2) <- dim3

Answer 4

数组只是具有维度的原子向量。 test的每个矩阵分量实际上只是具有维度的向量。因此，我能想到的最简单的解决方案是将列表test展开到一个向量中，并使用array和适当提供的维度将其转换为数组。

set.seed(1)
foo <- replicate( 5,  matrix(runif(25),ncol=5) )
tmp <- array(unlist(test), dim = c(5,5,5))

> all.equal(foo, tmp)
[1] TRUE
> is.array(tmp)
[1] TRUE
> dim(tmp)
[1] 5 5 5

如果您不想对尺寸进行硬编码，我们必须做出一些假设，但可以轻松填写test的尺寸，例如

tmp2 <- array(unlist(test), dim = c(dim(test[[1]]), length(test)))

> all.equal(foo, tmp2)
[1] TRUE

这假设每个组件的尺寸都是相同的，但是如果那个条件不成立，我看不出如何将子矩阵放入三维数组中。

这可能看起来很糟糕，要展开列表，但这只是利用R如何处理矩阵和数组作为具有维度的向量。

将2d矩阵列表堆叠成3d矩阵的功能方法

4 个答案: