Question

从

安装RPy2后

http://rpy.sourceforge.net/rpy2.html

我正在尝试在Python 2.6 IDLE中使用它，但是我收到了这个错误：

>>> import rpy2.robjects as robjects
>>> robjects.r['pi']

<RVector - Python:0x0121D8F0 / R:0x022A1760>

我做错了什么？

Answer 1

您是否尝试过查看返回的矢量？

 >>> pi = robjects.r['pi']
 >>> pi[0]
 3.14159265358979

Answer 2

扩展Shane的答案。 rpy2使用以下Python对象来表示基本的R类型：

RVector：R标量和向量，R列表表示为带有名称的RVectors，见下文
RArray：R矩阵，基本上是具有维度
RDataFrame：R data.frame

强制回归基本的Python类型look here。

作为示例，我使用它将R List转换为python dict：

rList = ro.r('''list(name1=1,name2=c(1,2,3))''')
pyDict = {}
for name,value in zip([i for i in rList.getnames()],[i for i in rList]):
    if len(value) == 1: pyDict[name] = value[0]
    else: pyDict[name] = [i for i in value]

Answer 3

在Python交互式解释器中，如果表达式返回一个值，则会自动打印该值。例如，如果您创建一个字典并从中提取值，则会自动打印该值，但如果这是在执行脚本中，则情况并非如此。看看下面的简单示例，这不是错误，只是python打印表达式的结果：

>>> mymap = {"a":23}
>>> mymap["a"]
23

python脚本中的相同代码根本不会产生任何输出。

在您的代码中，您正在使用代码访问类似结构的地图：

>>> robjects.r['pi']

这将返回一些R2Py对象，其默认字符串表示形式为：<RVector - Python:0x0121D8F0 / R:0x022A1760>

如果您将代码更改为：

pi = robjects.r['pi']

您将看不到输出，但调用的结果（向量）将被分配给变量pi并可供您使用。

查看R2Py documentation默认情况下，许多对象默认打印为＆lt;＆gt;中的类型括号和一些内存地址信息。

Answer 4

这不是错误，它只是返回的robject的'repr'：

>>> r['pi']
<RVector - Python:0x2c14bd8 / R:0x3719538>
>>> repr(r['pi'])
'<RVector - Python:0x4b77908 / R:0x3719538>'
>>> str(r['pi'])
'[1] 3.141593'
>>> print r['pi']
[1] 3.141593

您可以通过索引

获取“pi”的值

>>> r['pi'][0]
3.1415926535897931

要访问命名列表的元素（' object $ attribute 'R语法），我使用

>>> l = r.list(a=r.c(1,2,3), b=r.c(4,5,6))
>>> print l
$a
[1] 1 2 3

$b
[1] 4 5 6

>>> print dict(zip(l.names, l))['a']
[1] 1 2 3

但我认为必须有更好的解决方案......

Answer 5

我发现这是关于如何从R对象和python来回走动的唯一合理，简短的讨论。 naufraghi的解决方案促使了以下方法转换data.frame，它保留了数据帧的更好的切片功能：

In [69]: import numpy as np

In [70]: import rpy2.robjects as ro

In [71]: df = ro.r['data.frame'](a=r.c(1,2,3), b=r.c(4.0,5.0,6.3))

In [72]: df
Out[72]: <RDataFrame - Python:0x5492200 / R:0x4d00a28>

In [73]: print(df)
  a   b
1 1 4.0
2 2 5.0
3 3 6.3

In [74]: recdf = np.rec.fromarrays(df, names=tuple(df.names))

In [75]: recdf
Out[75]: 
rec.array([(1, 4.0), (2, 5.0), (3, 6.2999999999999998)], 
      dtype=[('a', '<i4'), ('b', '<f8')])

此时似乎有点偏离主题，但我不确定采用这个问题的适当程序是什么？我的回答！

RPy2的奇怪问题

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