Graphviz中的图形图

Question

我有一组用DOT语言编码的有向图。我想构建一个图形图形，使得超图中的每个节点都是这些有向图之一。有没有办法在GraphViz框架内执行此操作？

我知道gvpack允许我将多个图组合成一个.dot文件。但我不知道它是否允许我在这些图之间声明边缘。

Answer 1

简短的回答是gvpack没有声明子图之间的边。实际上，当子图之间存在公共节点名称时，gvpack会重命名它们以避免冲突。但是，这是可以解决的。

例如，给定三个.dot个文件1.dot：

digraph {
    A -> B
    A -> C
    }

2.dot：

digraph {
    D -> E
    E -> F
    }

...和3.dot：

digraph {
    D -> G
    G -> A
    }

...正在运行gvpack -u 1.dot 2.dot 3.dot | dot -Tjpg -ogvp1.jpg会显示以下图表gvp1.jpg：

如您所见，gvpack重新标记了重复的节点名称。但是，我们可以使用gvpack -u 1.dot 2.dot 3.dot | sed 's/_gv[0-9]\+//g' | dot -Tjpg -ogvsub.jpg轻松撤消重新标记，生成以下图gvsub.jpg：

此方法依赖于具有共同节点名称的子图，因此可能需要在子图.dot文件中插入其他节点来实现此目的。

（编辑：上面的解决方案显示了节点合并但不与群集中的子图合并的图。以下解决方案显示了群集中的子图。）

给定.dot个文件1.dot（这些与上面的文件相同，除了我给每个有向图命名）：

digraph g1 {
    A -> B
    A -> C
    }

2.dot：

digraph g2 {
    D -> E
    E -> F
    }

...和3.dot：

digraph g3 {
    D -> G
    G -> A
    }

...以及hdr.dot：

digraph GMaster {
    compound = true;
    g1 [style=invisible, height = 0, width = 0, label=""];
    g2 [style=invisible, height = 0, width = 0, label=""];
    g3 [style=invisible, height = 0, width = 0, label=""];
    g1 -> g2 [lhead=clusterg2, ltail=clusterg1];
    g1 -> g3 [lhead=clusterg3, ltail=clusterg1]

...和tail.dot：

}

...我们可以运行cat 1.dot 2.dot 3.dot | sed 's/digraph \(\w*\) *{/subgraph cluster\1 { \1/' | cat hdr.dot - tail.dot | dot -Tjpg -oclust1.jpg来提供文件clust1.jpg：

因此，在头文件中，我为每个子图添加了一个invisble节点，其名称与子图相同，使用compound=true来允许集群之间的边缘。我已经指定了在簇之间绘制的边缘，并且我为不可见节点之间的每个边设置了lhead和ltail，以确保将正确的簇用作头部和尾部。每个边缘。在使用sed将每个子图转换为集群的过程中，我还为每个子图添加了适当的不可见节点。

显示节点D，G和A之间的边缘，因为这些节点在群集之间是公共的。此外，它们中的每一个仅显示在一个群集中。如果节点对于簇是唯一的，则在簇之间显示的唯一边缘将是不可见节点之间的边缘。这可以在下图中看到，我在3.dot中重命名了节点：

还有一个我无法解决的缺陷。不可见节点仍占用一点空间，因此集群框看起来不平衡，因为隐藏节点位于可见节点旁边。这也意味着簇之间的边缘的头部指向簇盒的一侧而不是中间。目前，我无法看到可以做些什么，除非我们准备查看每个子图并找到一个已经在该子图/集群中的节点作为该子图/集群的代表节点（即我们为该集群绘制边缘的一个或多个。对于一些子图，这可以很容易地手工完成，但如果有很多子图则会很乏味。

相比之下，我上面使用的方法只需要知道集群的名称，并可以将其插入hdr.dot文件中。

我为这种情况手动构建了hdr.dot文件，但hdr.dot文件的内容可以从其他.dot文件中提取sed，{如果有需要，请{1}}，awk或perl。如果有关哪些集群应该连接的信息在某处可用，脚本还可以插入边缘以将集群链接到python。

Answer 2

处理此问题的最简单方法是允许gvpack执行重命名，而不是尝试反向重命名，以声明节点的标签。

以

开头

digraph g1 {
  A -> B; 
  A -> C;
  A [label="A"];
  B [label="B"];
  C [label="C"];
}

和

digraph g2 {
  D -> E
  E -> F
  D [label="D"];
  E [label="E"];
  F [label="F"];
}

和

digraph g3 {
  D -> G
  G -> A
  D [label="D"];
  G [label="G"];
  A [label="A"];
}

您应该从最初的第一步中获得想要的结果