R中的Mantel测试

Question

我正在尝试在两个距离（地理距离和遗传Distancse ）的 R 中运行 Mantel 测试。

数据以2列保存在 Excel 文件中;每行具有2个种群之间的地理距离和遗传距离。

我正在运行以下命令，由于某种原因返回错误

mantel.rtest(mydata$Dis, mydata$Fst, nrepet = 99)

错误信息如下：

Error in mantel.rtest(mydata$Time, mydata$Fst, nrepet = 99) : 
  Object of class 'dist' expected

非常感谢任何反馈。

Answer 1

您必须将数据转换为dist（）数据。 dis.dist＆lt; -dist（mydata $ Dis）和fst.dist＆lt; -dist（mydata $ Fst）然后使用dist值运行mantel.rtest。