为什么pandas groupby()。transform()需要一个唯一索引?

时间:2013-05-01 02:14:38

标签: python pandas

我想使用groupby()。transform()对(已排序)数据集中的每个记录块进行自定义(累积)转换。除非我确保我有一个唯一的密钥,否则它不起作用。为什么呢?

这是一个玩具示例:

df = pd.DataFrame([[1,1],
                  [1,2],
                  [2,3],
                  [3,4],
                  [3,5]], 
                  columns='a b'.split())
df['partials'] = df.groupby('a')['b'].transform(np.cumsum)
df

给出了预期的结果:

     a   b   partials
0    1   1   1
1    1   2   3
2    2   3   3
3    3   4   4
4    3   5   9

但是如果'a'是关键,那么一切都会出错:

df = df.set_index('a')
df['partials'] = df.groupby(level=0)['b'].transform(np.cumsum)
df

---------------------------------------------------------------------------
Exception                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-146-d0c35a4ba053> in <module>()
      3 
      4 df = df.set_index('a')
----> 5 df.groupby(level=0)['b'].transform(np.cumsum)

/opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pandas/core/groupby.pyc in transform(self, func, *args, **kwargs)
   1542             res = wrapper(group)
   1543             # result[group.index] = res
-> 1544             indexer = self.obj.index.get_indexer(group.index)
   1545             np.put(result, indexer, res)
   1546 

/opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/pandas/core/index.pyc in get_indexer(self, target, method, limit)
    847 
    848         if not self.is_unique:
--> 849             raise Exception('Reindexing only valid with uniquely valued Index '
    850                             'objects')
    851 

Exception: Reindexing only valid with uniquely valued Index objects

如果在分组前选择列'b',即

,则会出现相同的错误
df['b'].groupby(level=0).transform(np.cumsum)

但如果您转换整个数据框,则可以使其工作,例如:

df.groupby(level=0).transform(np.cumsum)

甚至是一列数据框(而非系列):

df.groupby(level=0)[['b']].transform(np.cumsum)

我觉得GroupBy-fu还有一些我缺少的深层次。有人可以让我直截了当吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:5)

这是一个错误,因为修复了大熊猫(肯定是在0.15.2,IIRC它固定在0.14),所以你不应再看到这个异常了。


作为解决方法,在早期的大熊猫中,您可以使用apply

In [10]: g = df.groupby(level=0)['b']

In [11]: g.apply(np.cumsum)
Out[11]:
a
1    1
1    3
2    3
3    4
3    9
dtype: int64

您可以将其分配给df

中的列
In [12]: df['partial'] = g.apply(np.cumsum)