Question

我有两个30米x 30米的光栅文件，我想从中采样点。在采样之前，我想从图像中去除混浊区域。我转向R和Hijman的Raster包来完成任务。

使用drawPoly（sp = TRUE）命令，我绘制了18个不同的多边形。该函数似乎不允许18个多边形作为一个sp对象，所以我将它们全部分开绘制。然后我给多边形一个与光栅匹配的proj4string，并将它们设置为一个列表。我通过一个lapply函数运行列表，将它们转换为栅格（Hijman包中的栅格化函数），多边形区域设置为NA，图像的其余部分设置为1.

我的最终目标是一个栅格图层，其中18个区域设置为NA。我已经尝试堆叠光栅化多边形列表，并将其子集化以将新栅格设置为相同区域中的NA。我的可重复代码如下。

library(raster)
r1 <- raster(nrow=50, ncol = 50)
r1[] <- 1
r1[4:10,] <- NA
r2 <- raster(nrow=50, ncol = 50)
r2[] <- 1
r2[9:15,] <- NA
r3 <- raster(nrow=50, ncol = 50)
r3[] <- 1
r3[24:39,] <- NA

r4 <- raster(nrow=50, ncol = 50)
r4[] <- 1

s <- stack(r1, r2, r3)

test.a.cool <- calc(s, function(x){r4[is.na(x)==1] <- NA})

无论出于何种原因，darn testacool都是一个空白的图，我的目标是将它作为一个栅格，除了堆栈中的NA（s）等于1之外的所有值。

任何提示？

感谢。

Answer 1

执行sum(s)会有效，因为sum()会为堆栈中包含一个NA值的任何网格单元返回NA。

要查看它是否有效，请比较以下产生的数字：

plot(s)
plot(sum(s))

Answer 2

我也在R-Sig-Geo论坛上发布了这个问题，并收到了包裹作者的回复。两个最简单的解决方案：

使用sp包将我的多边形转换为一个，然后栅格化多边形。

p <- rbind(p1, p2, p3...etc., makeUniqueIDs = TRUE)

r4 <- raster(nrow=50, ncol = 50)
r4[] <- 1
mask <- rasterize(p, r4)
mask[mask %in% 1:18] <- 1
#The above code produces a single raster file with 
#my polygons as unique values, ready for masking.

第二个简单的解决方案，正如Josh O'Brien所指出的那样：

m <- sum(s)
test <- mask(r4, m)

R社区摇滚。问题在一小时内解决了（两次）。感谢。

Answer 3

我不熟悉您正在使用的软件包，但是查看代码中的最后一行，我认为问题可能就在这里：

 function(x){r4[is.na(x)==1] <- NA})

calc看起来不会那样做。它设置r4的{{1}}索引的NA的值，并将其设置为x。

然后呢？如果有的话，也许：

NA

虽然，目前尚不清楚这是否是你所追求的。

Answer 4

你走在正确的轨道上。 [运算符是为栅格和栅格堆栈定义的，因此您只需使用单行：

r4[ any(is.na(s) ) ] <- NA
plot(r4)

如果您想使用calc，可以像这样使用它：

r4 <- calc( s, function(x){ ( ! any( is.na(x) ) ) } )
r4[is.na(r4)] <- NA
plot(r4)

将单个栅格设置为NA，其中栅格堆栈的值为NA

4 个答案: