如何调试从命令行运行的Rscripts？
我目前正在使用getopt包来传递命令行选项，当出现错误时我很难，我很难：
R中以交互方式进行调试（因为脚本需要命令行选项。）有没有人有示例代码并愿意分享？
答案 0 :(得分：6)
您可以使用--args将命令行参数传递到交互式shell中，然后将源代码（''）传递给脚本。
$ R --args -v
R version 2.8.1 (2008-12-22)
Copyright (C) 2008 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
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'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
> require(getopt)
Loading required package: getopt
> opt = getopt(c(
+ 'verbose', 'v', 2, "integer"
+ ));
> opt
$verbose
[1] 1
> source('my_script.R')
您现在可以使用旧的browser（）函数进行调试。
答案 1 :(得分：3)
我要么使用老式的印刷语句，要么使用交互式分析。为此，我首先使用save()保存状态，然后将其加载到交互式会话中（我使用Emacs / ESS）。这允许在逐行的基础上使用脚本代码进行交互式工作。
但是我经常在以较小的脚本部署之前以交互模式编写/测试/调试代码。
答案 2 :(得分：3)
另一种选择是使用选项（错误）功能。这是一个简单的例子：
options(error = quote({dump.frames(to.file=TRUE); q()}))
您可以根据需要在错误情况下创建详尽的脚本，因此您应该只决定调试所需的信息。
否则，如果您关注的是特定区域（例如连接到数据库），请将它们包装在tryCatch（）函数中。