近交系数计算和系谱软件

Question

我目前正在寻找一种能够映射大量GEDCOM文件（大约33,000个人）以及制定祖先和个体近亲繁殖系数的软件。有谁知道任何有能力的软件????

谢谢

Answer 1

我认为你不会找到任何能为你做到这一点的软件，但编写自己的软件也不会太难。我将采用众多开源gedcom解析器中的一个，并将个体添加到图形数据库，例如Neo4j。一旦进入Neo4j，就可以相对容易地对个人进行计算。

Answer 2

GeneWeb（用ML编写）可以很好地处理大文件并具有快速的血缘系数计算。我相信它会在导入时计算数据库中每个人的血缘系数，并在几秒钟内完成。它还显示任意深度的祖先和后代树，没有任何明显的滞后。

http://cristal.inria.fr/~ddr/GeneWeb/en/index.html#Par

它还可以处理任意数量的GEDCOM。

Answer 3

您可能对Pypedal Python谱系分析感兴趣，这是一个Python模块，提供了家谱操作，谱系简单可视化和遗传多样性测量计算的工具。来自血统。