我尝试通过在system（）调用中调用该命令，从我的代码中调用一个程序（ncbi blast，对于那些需要知道的人）。
如果我直接在shell中执行字符串，它按预期工作，但如果我通过system（）尝试相同的字符串，程序返回得更快，没有预期的结果。输出文件已创建，但文件大小为0.返回的错误代码也为0.我甚至尝试附加“＆gt; output.log 2＆gt; error.log”，但不会创建这些文件。
我想这与环境变量或路径有关...
输出文件名是通过-o命令行参数给出的，而不是输出重定向。
我读过一些关于popen命令可能更适合我的用例的内容，但我找不到它，哪个库来自哪个？
答案 0 :(得分：1)
此类问题的最常见原因是~/.bashrc中的环境变量设置不正确。
您应该能够通过执行
来查看ncbi不满意的内容
$SHELL -c '<exact string you pass to system()>'
调试此问题的另一种常见方法是使用strace。执行：
strace -fo /tmp/strace.out ./myProgram
并查看/tmp/strace.out中的线索。
答案 1 :(得分：1)
您是否有任何理由不想fork和exec？这是从另一个进程执行一个进程的常用习惯用法。
答案 2 :(得分：0)
popen在标准C库中 See the man page
答案 3 :(得分：0)
一些简单的问题：
您终端的精确复制和粘贴比英文说明更可取。