通过比较字符串测试R中的警告(最好的主意?)

时间:2013-04-19 20:16:44

标签: r warnings

我正在研究R包,我需要一些帮助来编写R测试函数,这些函数用于检查是否在C端代码上抛出正确的警告然后在R端捕获。让我来谈谈我正在做的工作:

  1. 我写的大部分内容都是在C方面完成的。另外,我在C中有一个if语句类型的宏,允许编码器以字符串的形式向R传递警告。基本前提是if(statement_true)pass_warning_to_R(“要传递的警告字符串”)。我想做的是测试当我期望/需要这些警告是通过编写使用tryCatch块的R文件时是否抛出这些警告。
  2. 到目前为止,我写了类似的东西:

    counter <- 0
    tryCatch({
    
    function_im_testing()
    
    }, warning = function(war) {
         # Check if warning is as expected and if so increment counter
         if(toString(war)=="The warning I'm expecting/testing for"){
            print(toString(war))
            counter <- counter + 1
         }
    
    }, error = function(err) {
          print(toString(err))
    
    }, finally = {
    print("Leaving tryCatch")
    })
    
    # Stop if the 3 warnings we expected aren't present
    stopifnot(counter == 3)
    
  3. 这是我正在使用的方法,到目前为止,我甚至无法通过尝试获取toString(war)和“警告我期待/测试”来获取if语句。是一回事。除此之外,这种方法非常草率和不可靠,这使我相信有更好的方法。那么,有没有更好的方法来做到这一点?

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

通常会有警告,您希望继续进行评估; tryCatch用于停止评估。因此,请将withCallingHandlers与处理程序一起使用,以执行您想要的警告,然后调用'muffleWarning'重启。可以使用conditionMessage

提取错误/警告消息
counter <- 0L
withCallingHandlers({
    function_im_testing()
}, warning = function(w) {
    if (conditionMessage(w) == "The warning I'm expecting/testing for")
        counter <<- counter + 1L
    invokeRestart("muffleWarning")
})

由于您正在编写自己的包,因此创建可以以更健壮的方式识别的警告是有意义的,例如,以下内容返回可在warning中使用的条件,但具有可以在withCallingHandlers中使用的类'bad_input'。

bad_input <- function(...) {
    w <- simpleWarning(...)
    class(w) <- c("bad_input", class(w))
    w
}

warning(bad_input("your input is bad"))一样使用并使用

生成输出
fun <- function() {
    warning("oops")
    warning(bad_input("your input is bad"))
    "DONE"
}        

>     fun()
[1] "DONE"
Warning messages:
1: In fun() : oops
2: your input is bad 
>     counter <- 0L
>     withCallingHandlers(fun(), bad_input = function(w) {
+         counter <<- counter + 1L
+         invokeRestart("muffleWarning")
+     })
[1] "DONE"
Warning message:
In fun() : oops
> counter
[1] 1

答案 1 :(得分:4)

除了实际捕获警告之外,您还需要知道警告消息已被翻译:

library(devtools)
with_envvar(c(LANG = "en"), log(-1))
# In log(-1) : NaNs produced
with_envvar(c(LANG = "de"), log(-1))
# In log(-1) : NaNs wurden erzeugt
with_envvar(c(LANG = "fr"), log(-1))
# In log(-1) : production de NaN
with_envvar(c(LANG = "ko"), log(-1))
# In log(-1) : NaN이 생성되었습니다

因此,如果您在测试中执行此操作,请确保设置LANG环境变量以确保消息不会根据其运行的计算机而有所不同