细胞计数：选择性;只计算所有染色阳性的细胞

Question

如果我在不同的荧光通道中拍摄多个图像（用一些抗体/制造者染色细胞后），我如何自动定量每个标记阳性细胞的比例？有没有人在Python中做过这样的事情？

我已经可以使用Fiji（ImageJ）来计算仅包含一种染色类型的细胞，但是我无法对包含两种染色类型的合并图像进行选择性计数。由于斐济与python很好地交互，我想写一个脚本，查看每个只包含一种染色类型的图像，然后获得相应图像的x-y坐标并检查它们之间的匹配。我不确定这是不是一个好主意，我想知道，如果有人做过类似的事情或有更有效的方式来完成任务？

感谢您的帮助！

Answer 1

您可以使用cont = cv2.findcontours查找几乎圆形的单元格并对其进行计数 与len（续）。