如何在sed中匹配没有一些字符串的行

Question

我尝试打印文件夹下每个文件的第一行（以＆gt;作为文件是fasta文件开头），并使用sed提取出没有质粒和片段的那些行。

我做了ls * | xargs -I one sed -n -e '/^>.*[^fragment|plasmid].*/p' one > outfile 但它不起作用？我应该如何修改它？

Answer 1

我是否正确地认为您只想打印每个文件的第一行，如果该行不包含片段或质粒？那就是：

awk 'FNR==1 && !/fragment|plasmid/' *

如果这不是您想要的，请使用一些有代表性的样本输入和预期输出更新您的问题。

Answer 2

这对你有用吗？

head -q -n 1 * | egrep -v "^>.*(fragment|plasmid).*"

Answer 3

如果我将您的要求作为以＆gt;开头的打印行阅读除非它们含有片段或质粒，否则我认为这样做会为你做到：

sed -ne '/^>/{/fragment/;b;/plasmid/b;p;}' one > outfile

它忽略了所有不以＆gt;开头的行，如果它找到片段或质粒，它会跳到脚本末尾并转到下一行。