调用从MPI进程调用MPI进程的脚本

Question

我有一个MPI程序（Fortran，MPICH），我需要将其从一个脚本中解脱出来，然后脚本启动它自己的MPI程序（使用mpirun）。到目前为止，我已将shell（system）命令包装在if(system_num .eq. root_system_num)内，因此只有一个MPI进程运行该脚本。但是，这会导致一系列HYDU_create_process错误。

我考虑使用MPI_Comm_spawn，但是有一些警告，例如“如果您启动的程序是一个shell脚本并且该shell脚本启动一个调用MPI_INIT的程序，那么MPI不会说会发生什么”，所以这个似乎也不太理想。

有些观点：

• 在shell脚本中调用的程序根本不需要与调用程序进行交互。调用程序只需要等到该过程完成。
• 没有一种简单的方法可以将shell脚本转换为单独的可执行文件（许多环境变量设置，等等）。
• 理想情况下，这应适用于MPICH和Open MPI。

有办法做到这一点吗？

Answer 1

对于MPICH，遗憾的是，使用MPI_Comm_spawn可能最有效。您唯一的另一个选择是在调用嵌套MPI程序之前找出所有依赖于实现的，依赖于版本的环境变量，这些变量在shell脚本中需要unset。一些示例变量（对于MPICH）将包括PMI_RANK和PMI_PORT：

% mpiexec -n 1 env | egrep '^PMI|^HYD'
HYDI_CONTROL_FD=8
PMI_RANK=0
PMI_FD=7
PMI_SIZE=1

显然，Open MPI或不同版本的MPICH2 / MPICH需要对不同的变量进行调整。