替换R中现有矩阵中的随机值

时间:2013-04-09 15:53:18

标签: r

我有一个现有的矩阵,我希望以随机统一的方式用NA替换一些现有的值。

我尝试使用以下内容,但它只用NA替换了392个值,而不是我预期的452。我究竟做错了什么?

N <- 452

ind1 <- (runif(N,2,length(macro_complet$Sod)))

macro_complet$Sod[ind1] <- NA

summary(macro_complet$Sod)
    Min.  1st Qu.   Median     Mean  3rd Qu.     Max.     NA's 
  0.3222   0.9138   1.0790   1.1360   1.3010   2.8610 392.0000 

我的数据看起来像这样

> str(macro_complet)
'data.frame':   1504 obs. of  26 variables:
 $ Sod                     : num  8.6 13.1 12 13.8 12.9 10 7 14.8 11.3 4.9 ...
 $ Azo                     : num  2 1.7 2.2 1.9 1.89 1.61 1.72 2.1 1.63 2 ...
 $ Cal                     : num  26 28.1 24 28.5 24.5 24 17.4 26.6 24.8 10.5 ...
 $ Bic                     : num  72 82 81 84 77 68 66 81 70 37.8 ...
 $ DBO                     : num  3 2.2 3 2.7 3.3 3 3.2 2.9 2.8 2 ...
 $ AzoK                    : num  0.7 0.7 0.9 0.8 0.7 0.7 0.7 0.9 0.7 0.7 ...
 $ Orho                    : num  0.3 0.2 0.31 0.19 0.19 0.2 0.16 0.24 0.2 0.01 ...
 $ Ammo                    : num  0.12 0.16 0.15 0.13 0.19 0.22 0.19 0.16 0.17 0.08 ...
 $ Carb                    : num  0.3 0.3 2 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.5 ...
 $ Ox                      : num  10.2 9.7 9.8 9.6 9.7 9.1 9.1 8.1 9.7 10.6 ...
 $ Mag                     : num  5.5 6.5 6.3 7 6.4 5.1 6 6.7 5.7 2 ...
 $ Nit                     : num  4.2 4.7 5.7 4.6 4.2 3.5 4.9 4.5 4.2 2.8 ...
 $ Matsu                   : num  17 9 24 15 17 19 20 19 13 3.9 ...
 $ Tp                      : num  10.5 9.7 11.9 12 12.9 11.2 12.8 13.7 11.5 10.6 ...
 $ Co                      : num  3 3.45 3.3 3.54 2.7 2.7 3.3 3.49 2.8 1.8 ...
 $ Ch                      : num  17 24 22 28 25 19 13 28 23 6.4 ...
 $ Cu                      : num  25 15 20 20 15 20 15 15 20 15 ...
 $ Po                      : num  3.5 3.8 4 3.6 3.8 3.7 3 4.2 3.7 0.4 ...
 $ Ph                      : num  0.2 0.17 0.2 0.14 0.18 0.2 0.17 0.17 0.17 0.01 ...
 $ Cnd                     : int  226 275 285 295 272 225 267 283 251 61 ...
 $ Txs                     : num  93 88 89 86 87 88 84 80 91 94 ...
 $ Niti                    : num  0.06 0.09 0.07 0.06 0.08 0.07 0.08 0.11 0.1 0.01 ...
 $ Dt                      : num  9 9.7 9 10.2 8 8 7 9.4 8.5 3 ...
 $ H                       : num  7.6 7.7 7.6 7.7 7.55 7.4 7.3 7.5 7.5 7.6 ...
 $ Dco                     : int  17 12 15 13 15 20 16 14 12 7 ...
 $ Sf                      : num  22 20.5 18 22.2 22.1 21 11.6 21.7 21.9 6.8 ...

我也试图只为一个变量做这个,但得到了相同的结果。

我使用

将数据框转换为矩阵
as.matrix(n1)

然后我只为一个变量替换了一些值

N <- 300

ind <- (runif(N,1,length(n1$Sodium)))

n1$Sodium[ind] <- NA

然而,使用summary()我发现只有262个值被替换而不是300个。我做错了什么?

summary(n1$Sodium)
    Min.  1st Qu.   Median     Mean  3rd Qu.     Max.     NA's 
  0.3222   0.8976   1.0790   1.1320   1.3010   2.8610 262.0000

2 个答案:

答案 0 :(得分:6)

试试这个。这将对您的矩阵进行均匀采样而无需替换(因此不会选择相同的值并替换两次)。如果您想要其他分布,可以使用prob参数修改权重(请参阅?sample

vec <- matrix(1:25, nrow = 5)
vec[sample(1:length(vec), 4, replace = FALSE)] <- NA

vec
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]   NA    6   NA   16   NA
[2,]   NA    7   12   17   22
[3,]    3    8   13   18   23
[4,]    4    9   14   19   24
[5,]    5   10   15   20   25

答案 1 :(得分:2)

您必须在正确的位置应用runif,这是vec的索引。 (你现在的方式,你要求RNANA之间的统一分布中抽取随机数,这当然没有意义,所以它会让你回归NaN S)

尝试改为:

        N  <-  5                                   # the number of random values to replace
      inds <- round ( runif(N, 1, length(vec)) )   # draw random values from [1, length(vec)]
 vec[inds] <- NA                                   # use the random values as indicies to vec, for which to replace

请注意,使用round(.)并非必要,因为[[会接受数字,但它们都会被舍入 down 默认情况下,这比统一的dist略小。