Question

我有一个这种格式的文本文件

begin    end   
1        10    
25       35
40       50
37       48
...      ...

我使用这些命令创建一个列表，其中包含“begin”和“end”列值之间的所有值

x <- read.table("in.txt")

result <- vector("list",486)
      for(i in 1:486){
      result[[i]] <- c(x[i,1]:x[i,2])
      }
lapply(result, write, "out.txt", append=TRUE, ncolumns = 1)

因此，我得到一个包含1列的文件，其中所有值都在不同的行上。现在我想做一些额外的事情。

我没有只有'begin'和'end'列的输入文件，而是有两个额外的列，如下所示：

begin    end    A    B
1        10     x    0
25       35     x    1
40       50     x    2
37       48     y    0

我现在想要这些其他列的值也会出现在我的输出中，这样我就可以得到类似的内容了

position    A    B
1           X    0
2           X    0
3           X    0
...
10          X    0
...
40          X    2
41          X    2
...
37          Y    0

如何更改我的功能，以便输出看起来像这样？

Answer 1

这是一个data.table解决方案：

require(data.table)
DT <- data.table(DF, key=c("A", "B"))
DT[, list(pos = seq(begin, end, by=1)),by=key(DT)]

Answer 2

这是一个基本答案：

lapply(1:nrow(x), function(u) cbind(position=x$begin[u]:x$end[u], x[u,3:4]))

HTH

使用开始和结束位置之间的值创建列表

2 个答案: