Cuda编程直方图

时间:2013-04-03 08:27:54

标签: cuda gpu

我想要运行cuda程序,但我是初学者。我必须为直方图编写一个程序。 但是用水桶。根据maxValue(示例中为40),该数字将添加到相应的存储桶中。如果我们有4个桶:

  

histo:| 1 | 10 | 30 | 39 | 32 | 2 | 4 | 5 | 1 |

     

0-9(第1桶)

     

10-19(第二桶)

     

20-29(第3桶)

     

30-39(第4桶)

我的GPU有计算能力1.1。

我试图为每个线程在临时表上添加其值的块的共享temp []做一些事情:

__global__ void histo_kernel_optimized5( unsigned char *buffer, long size,
                               unsigned int *histo )
{
     extern __shared__ unsigned int temp[];
     temp[threadIdx.x] = 0;
     __syncthreads();

     int i = threadIdx.x + blockIdx.x * blockDim.x;
     int offset = blockDim.x * gridDim.x;
     int bucketID;
     while (i < size)
     {
              bucketID = array[i]/Bwidth;
              atomicAdd( &temp[bucketID], 1);
              i += offset;
     }
     __syncthreads();


    atomicAdd( &(histo[threadIdx.x]), temp[threadIdx.x] );
}

histo_kernel_optimized <<<array_size/buckets, buckets,buckets*sizeof(unsigned int)>>>(buffer,SIZE, histogram)

但编译器sais: 指令'{atom,red} .shared'需要。目标sm_12或更高

我还尝试为每个创建的线程设置临时表:

__global__ void histo_kernel_optimized5( unsigned char *buffer, long size,
                               unsigned int *histo )
{
    unsigned int temp[buckets];
     int j;
    for (j=0;j<buckets;j++){
        temp[j]=0;
    }

    int bucketID;

    int i = threadIdx.x + blockIdx.x * blockDim.x;
    int offset = blockDim.x * gridDim.x;
    while (i < size)
    {
        bucketID = array[i]/Bwidth;
        temp[bucketID]++;
        i += offset;
    }


    for (j=0;j<buckets;j++){
        histo[j] += temp[j];    
    }
 }

但编译器不允许我这样做,因为它需要一个常量来创建临时表。但问题是为命令行提供了桶动态

还有其他办法吗?我不知道怎么做。我很困惑。

3 个答案:

答案 0 :(得分:8)

使用原子时,启动较少的块将减少争用(从而提高性能),因为它不必在较少的块之间进行协调。启动更少的块,并使每个块循环遍历更多的输入元素。

for (unsigned tid = blockIdx.x*blockDim.x+threadIdx.x; 
              tid < size; tid += gridDim.x*blockDim.x) {
    unsigned char value = array[tid]; // borrowing notation from another answer here
    int bin = value % buckets;
    atomicAdd(&histo[bin],1);
}

答案 1 :(得分:4)

直方图使用原子操作非常容易实现。我不知道你为什么写这么复杂的内核。并行化操作的动机是利用算法的并行性。无需迭代内核中的整个直方图。下面是一个示例CUDA内核和包装函数,用于计算具有指定bin数的数组的直方图。 我不认为它可以进一步优化Compute 1.1设备。但是对于Compute 1.2,可以使用共享内存。

__global__ void kernel_getHist(unsigned char* array, long size, unsigned int* histo, int buckets)
{
    int tid = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;

    if(tid>=size)   return;

    unsigned char value = array[tid];

    int bin = value % buckets;

    atomicAdd(&histo[bin],1);
}

void getHist(unsigned char* array, long size, unsigned int* histo,int buckets)
{
    unsigned char* dArray;
    cudaMalloc(&dArray,size);
    cudaMemcpy(dArray,array,size,cudaMemcpyHostToDevice);

    unsigned int* dHist;
    cudaMalloc(&dHist,buckets * sizeof(int));
    cudaMemset(dHist,0,buckets * sizeof(int));

    dim3 block(32);
    dim3 grid((size + block.x - 1)/block.x);

    kernel_getHist<<<grid,block>>>(dArray,size,dHist,buckets);

    cudaMemcpy(histo,dHist,buckets * sizeof(int),cudaMemcpyDeviceToHost);

    cudaFree(dArray);
    cudaFree(dHist);
}

答案 2 :(得分:0)

对于没有原子操作的设备有一个解决方案,并显示了一种最小化片上内存冲突的方法,其中细分为Podlozhnyuk在Histogram calculation in CUDA

引起的扭曲

代码位于CUDASamples \ 3_Imaging \ histogram(来自CUDA样本)