Question

我使用R包'stats'（版本2.15.3）分析了我的数据。一位评论员问我这个包的正确引用，而不仅仅是常见的

R核心团队（2012年）。 R：统计计算的语言和环境。 R统计计算基金会，奥地利维也纳。 ISBN 3-900051-07-0，URL http://www.R-project.org/

任何人都知道在哪里可以找到有效的引文插入我的论文？感谢

Answer 1

评论员错了：

 citation("stats")

The ‘stats’ package is part of R.  To cite R in publications use:

  R Core Team (2013). R: A language and environment for statistical computing. R
  Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. ISBN 3-900051-07-0, URL
  http://www.R-project.org/.

A BibTeX entry for LaTeX users is

  @Manual{,
    title = {R: A Language and Environment for Statistical Computing},
    author = {{R Core Team}},
    organization = {R Foundation for Statistical Computing},
    address = {Vienna, Austria},
    year = {2013},
    note = {{ISBN} 3-900051-07-0},
    url = {http://www.R-project.org/},
  }

We have invested a lot of time and effort in creating R, please cite it when
using it for data analysis. See also ‘citation("pkgname")’ for citing R
packages.

Answer 2

在我们最近的book中，我的合着者和我做了R引用（在前线），但也让出版商让我们也给予每包信用：

enter image description here

我们认为重要的是要确保那些完成工作的人一直得到信誉。

（我只是做了这个评论，但是不能轻易地嵌入pix，并且不想在某个地方主持img。）

Answer 3

正如hrbrmstr指出的那样，创建仅加载的包的引用列表的函数会派上用场。因为他只向我们展示了一个例子而不是函数，我自己写了一篇，我经常在科学分析和论文中使用它（有时与R Markdown相结合）。

citations <- function(includeURL = TRUE, includeRStudio = TRUE) {
    if(includeRStudio == TRUE) {
        ref.rstudio <- RStudio.Version()$citation
        if(includeURL == FALSE) {
            ref.rstudio$url = NULL;
        }
        print(ref.rstudio, style = 'text')
        cat('\n')
    }

    cit.list <- c('base', names(sessionInfo()$otherPkgs))
    for(i in 1:length(cit.list)) {
        ref <- citation(cit.list[i])
        if(includeURL == FALSE) {
            ref$url = NULL;
        }
        print(ref, style = 'text')
        cat('\n')
    }
}

因此，例如，在运行

之后

library(readr)
library(dplyr)
library(ggplot2)
library(knitr)

功能 citations() 将打印：

RStudio团队（2016年）。 RStudio：R 的集成开发环境。 RStudio，Inc.，Boston，MA。 http://www.rstudio.com

R核心团队（2017年）。 R：统计计算的语言和环境。 R统计基金会计算，维也纳，奥地利。 https://www.R-project.org

谢（2016）。 knitr：R 中动态报告生成的通用软件包。 R包版本1.15.1，http://yihui.name/knitr。

谢谢（2015）。 带R和knitr的动态文档，第2版。查普曼和霍尔/ CRC，佛罗里达州博卡拉顿。 ISBN 978-1498716963，http://yihui.name/knitr。

谢叶（2014）。 “knitr：R中可重复研究的综合工具”，Stodden V，Leisch F和Peng RD （编辑），实施可重复的计算研究。查普曼和霍尔/ CRC。 ISBN 978-1466561595， http://www.crcpress.com/product/isbn/9781466561595

Wickham H（2009）。 ggplot2：用于数据分析的优雅图形。 Springer-Verlag纽约。国际标准书号 978-0-387-98140-6，http://ggplot2.org。

Wickham H和Francois R（2016）。 dplyr：数据处理的语法。 R包版本0.5.0，https://CRAN.R-project.org/package=dplyr。

Wickham H，Hester J和Francois R（2016）。 readr：读取表格数据。 R包版本1.0.0，https://CRAN.R-project.org/package=readr。

Answer 4

现在有一个grateful包可以很方便：

感激的目标是让R包很容易引用用于任何报告或出版物。通过调用单个函数，它将扫描项目中使用的R包并生成一个文档所需输出格式的引文（Word，PDF，HTML，Markdown）。重要的是，这些引用可以针对特定日志进行格式化这样我们就可以直接将它们粘贴到参考书目列表中我们的手稿或报告。

https://github.com/Pakillo/grateful

如果加载了包stats，则可以通过运行以下来获取引用：

library(grateful)
cite_packages()

- 已经通过运行安装grateful来安装：

library(devtools)
install_github("Pakillo/grateful")

Answer 5

我喜欢 MS Berends 的解决方案，但想要一个版本号如 this answer 的表。我还想摆脱 format(citation(pkg), style = 'text') 生成的 Markdown，这样我就可以轻松地复制粘贴到 MS Word 中。

require(pacman)
require(gt)
require(stringr)
require(dplyr)
get_package_citation_table <- function(){
  appendix_packages <- data.frame(Package = character(),
                                  Version = character(),
                                  Maintainer = character(),
                                  Citation = character())
  
  for (pkg in p_loaded()){
    appendix_packages <- appendix_packages %>% add_row(
      Package = pkg,
      Version = as.character(packageVersion(pkg)),
      Maintainer = maintainer(pkg),
      Citation = format(citation(pkg), style = 'text')
    )
  }
  appendix_packages <- appendix_packages %>% 
    add_row(
      Package = "RStudio",
      Version = as.character(RStudio.Version()$version),
      Maintainer = "",
      Citation = format(RStudio.Version()$citation, style = "text") 
    ) %>%
    add_row(
      Package = "R",
      Version = paste(version$major,version$minor, sep="."),
      Maintainer = "",
      Citation = format(citation(), style = "text")
    )
  
  appendix_packages %>%
    mutate( Citation = Citation %>% # strip out the markdown
              str_replace_all("_","") %>%
              str_replace_all("[*]", "") %>%
              str_replace_all("<URL:", "") %>%
              str_replace_all(">","")) %>% 
    arrange(Package)
  
}

t<- get_package_citation_table() 
t %>% gt()

R“stats”引用科学论文

5 个答案: