查询PyTables嵌套列

Question

我有一个带有嵌套表列的表，路由。在其下面是另外两种嵌套数据类型，master和slave都有一个整数id和字符串类型字段。

我想运行类似table.readWhere（'route / master / id == 0'）的东西，但我得到“变量route指的是嵌套列，不允许在条件”< /强>

是否有一种方法可以在pytables中查询嵌套数据类型？

Answer 1

您必须创建要在条件字符串中使用的变量。一种选择是定义变量字典：

table.readWhere('rId==0', condvars={'rId': table.cols.route.master.id})

另一种选择是为条件中使用的列定义局部变量。

rId = table.cols.route.master.id
table.readWhere('rId==0')

由于这会污染命名空间，我建议您创建一个包装代码的函数。我试图引用列本身，但似乎解释器在抛出NameError之前获取整个数据集。

table.readWhere('table.cols.route.master.id==0') # DOES NOT WORK

有关library reference中的where（）方法的更多信息。

Answer 2

以streeto的答案为基础，这是一种在构造查询时快速访问表中所有嵌套列的方法

condvars = {k.replace('/', '__'): v for k, v in table.colinstances.items()}
result = table.read_where('route__master__id == 0', condvars=condvars)

table.colinstances返回一个平面dict，其键是表中所有列（包括嵌套列）的斜线分隔路径，并且其值是位于该路径的PyTables Col类的实例。您不能在查询中使用斜杠分隔的路径，但是如果您替换为Python标识符中允许的其他分隔符（在这种情况下，我选择了双下划线），则一切正常。您可以根据需要选择其他分隔符。