根据Mayavi iso_surface中的高度更改颜色

时间:2013-03-26 13:21:12

标签: python vtk enthought mayavi

是否可以根据点的高度(在python / mayavi中)改变等值面的颜色? 我可以使用我的脚本创建一个iso-surface可视化,但是我不知道如何使iso_surface用z轴改变颜色,这样它就会让底部为黑色,底部为白色。 我需要这个,以便从图表正上方查看时可以理解可视化。 如果您知道其他任何方法,请告诉我。 我只想展示一个iso_surface图。

1 个答案:

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我设法通过合并示例http://docs.enthought.com/mayavi/mayavi/auto/example_atomic_orbital.html#example-atomic-orbitalhttp://docs.enthought.com/mayavi/mayavi/auto/example_custom_colormap.html中的一些代码来实现这一目标。基本上你必须像原子轨道例子那样创建一个表面,然后根据x改变颜色。您必须为x创建一个值数组。我的代码是(相关部分):

  #src.image_data.point_data.add_array(np.indices(list(self.data.shape)[self.nx,self.ny,self.nz])[2].T.ravel())
  src.image_data.point_data.add_array(np.indices(list(self.data.shape))[0].T.ravel())
  src.image_data.point_data.get_array(1).name = 'z'
  # Make sure that the dataset is up to date with the different arrays:
  src.image_data.point_data.update()
  # We select the 'scalar' attribute, ie the norm of Phi
  src2 = mlab.pipeline.set_active_attribute(src, point_scalars='scalar')
  # Cut isosurfaces of the norm
  contour = mlab.pipeline.contour(src2)
  # contour.filter.contours=[plotIsoSurfaceContours]
  # contour.filter.contours=[plotIsoSurfaceContours[0]]
  min_c = min(contour.filter._data_min * 1.05,contour.filter._data_max)
  max_c = max(contour.filter._data_max * 0.95,contour.filter._data_min)
  plotIsoSurfaceContours = [ max(min(max_c,x),min_c) for x in plotIsoSurfaceContours ]
  contour.filter.contours= plotIsoSurfaceContours

  # Now we select the 'angle' attribute, ie the phase of Phi
  contour2 = mlab.pipeline.set_active_attribute(contour, point_scalars='z')
  # And we display the surface. The colormap is the current attribute: the phase.
  # mlab.pipeline.surface(contour2, colormap='hsv')
  xxx = mlab.pipeline.surface(contour2, colormap='gist_ncar')
  colorbar = xxx.module_manager.scalar_lut_manager
  colorbar.reverse_lut = True
  lut = xxx.module_manager.scalar_lut_manager.lut.table.to_array()
  lut[:,-1] = int(plotIsoSurfaceOpacity * 254)
  xxx.module_manager.scalar_lut_manager.lut.table = lut
  # mlab.colorbar(title='Phase', orientation='vertical', nb_labels=3)

self.data是我的数据,如果您想设置曲面的不透明度,原因不明,您必须首先反转lut然后设置不透明度。使用254而不是255进行乘法以避免mayavi中可能存在的错误。 我希望这有助于某人。