Question

我正在尝试从另一个包predict导入一个S3方法pls。我有一个使用这些预测值的函数。问题是，在编译包时：

Error : object 'predict' is not exported by 'namespace:pls'

我将this Gist放在一起作为一个最小的例子，它突出了我的问题并包含以下R文件：

#' Test function
#' 
#' @importFrom pls predict
#' 
#' @export

myfunc <- function(x){
  stopifnot(class(x) == "mvr")
  predict(x)*2
}

Answer 1

总结一下，因为原文（下方）现已过时，并且有错误或误导的地方。

近端问题是 pls 包中没有名为predict的函数; predict有一些未导出的S3方法，但没有predict。所以你不能导入它。 predict通用版存在于 stats 包中，您需要从中导入，如下所述。

您的资料包需要Depends: pls DESCRIPTION才能让正确的predict方法可供R使用。请中没有任何内容可供您使用可以专门导入。

您还需要从统计信息命名空间中导入predict泛型，因此请添加

#' @importFrom stats predict

因为它将导入您的包命名空间中的泛型。您还需要将Imports: stats添加到DESCRIPTION文件中，以表明您需要统计信息包;以前我们不必声明R附带的基本软件包集合的依赖关系（即R附带的非推荐的基础软件包）。

原始

这里的主要问题是请没有定义函数/方法predict。它为predict泛型提供了几种方法，但不提供通用本身。

如果需要，您需要从 stats 包中导入泛型 - 我不确定您是否这样做，因为您没有创建需要或基于泛型的功能。至少你需要

#' @importFrom stats predict

虽然您可能需要/想要导入整个 stats 命名空间 - 取决于您的软件包在您当前正在处理的功能之外所做的事情。

另一个问题是从请命名空间

导出predict.mvr
> require(pls) Loading required package: pls Attaching package: ‘pls’ The following object(s) are masked from ‘package:stats’: loadings > predict.mvr Error: object 'predict.mvr' not found > pls::predict.mvr Error: 'predict.mvr' is not an exported object from 'namespace:pls' > pls:::predict.mvr function (object, newdata, ncomp = 1:object$ncomp, comps, type = c("response", "scores"), na.action = na.pass, ...)

因此你不能只导入它。因此，您的包需要在Depends: pls中包含DESCRIPTION才能找到正确的predict方法。

从另一个包导入S3方法

1 个答案:

原始