如何访问不同的python模块版本？

Question

所以我正在使用共享计算机。它是整个部门计算的主力。我们遇到的问题是控制导入模块的版本。以Biopython为例。有些人对旧版本的biopython有要求 - 1.58。而其他人对最新的biopython有要求 - 1.61。我如何并排安装两个版本的模块，以及如何专门访问特定版本。我问，因为有时这些api会改变并打破其他人的旧脚本（或者他们期望某些功能不再存在）。

我知道可以在本地（即每个用户）安装模块，并专门将python指向该模块。还有另一种方法来处理这个问题吗？或者每个人都必须在使用之前创建导出PYTHONPATH？

Answer 1

我不确定是否可以更改给定模块的有效安装版本。鉴于我对进口和网站包如何运作的理解，我倾向于否。

您是否考虑过使用virtualenv？

使用virtualenv，您可以创建多个共享环境 - 一个用于biopython 1.58，另一个用于1.61，另一个用于您需要的任何其他特殊情况。它们不需要被锁定到特定用户，因此虽然它会占用比您想要的更多的空间，但它可能比拥有自己的python环境的每个人占用更少的空间。

Answer 2

听起来你在做科学计算。您应该使用Anaconda，并特别注意conda工具documented here。

Conda尽可能使用硬链接以避免复制相同的文件。它还以比virtualenv（例如VTK上的virtualenv chokes）更好的方式管理非python二进制模块。