陷阱rpy2中的R错误

Question

当我使用RStudio时，我可以在运行函数时看到任何错误或警告。

但是当我使用rpy2时，如何捕获警告（允许代码运行）和错误（停止代码），以便我可以在python中以编程方式解析消息？

Answer 1

在R-3.0（当前未发布）之前，默认情况下会向控制台输出警告。 从R-3-0开始，它们不再被打印，因为R开发人员使之前使用的C函数隐藏（并且太忙而无法记录原因并告诉我们是否可以返回该功能）。

要将警告作为rpy2对象获取，您可以执行以下操作：

from rpy2.robjects.packages import importr
base = importr('base')
# do things that generate R warnings
base.warnings()

评估R代码时发生的错误会引发rpy2.rinterface.RRuntimeError。抓住那些。