Question

这只是parallel-python标签的第二个问题。通过浏览文档和谷歌搜索主题，我来到这里，因为它是我得到答案和建议最好的运气。

以下是API（我认为它被称为）将所有相关信息提交给pp。

    def submit(self, func, args=(), depfuncs=(), modules=(),
        callback=None, callbackargs=(), group='default', globals=None):
    """Submits function to the execution queue

        func - function to be executed
        args - tuple with arguments of the 'func'
        depfuncs - tuple with functions which might be called from 'func'
        modules - tuple with module names to import
        callback - callback function which will be called with argument
                list equal to callbackargs+(result,)
                as soon as calculation is done
        callbackargs - additional arguments for callback function
        group - job group, is used when wait(group) is called to wait for
        jobs in a given group to finish
        globals - dictionary from which all modules, functions and classes
        will be imported, for instance: globals=globals()
    """

这是我的提交声明及其参数：

job_server.submit(reify, (pop1, pop2, 1000), 
                  depfuncs = (key_seq, Chromosome, Params, Node, Tree), 
                  modules = ("math",), 
                  callback = sum.add, globals = globals())

depfuncs中的所有大写名称都是类的名称。我不确定在何处放置类，或者即使我需要将它们包含在globals()字典中。但是当我使用depfuncs()为空运行它时，会引发错误，例如“Tree not defined”（例如）。

现在，key_seq是一个生成器，因此我必须使用它的一个实例才能使用.next()：

def key_seq():
    a = 0
    while True:
        yield a
        a = a + 1
ks = key_seq()

ks在globals()中定义。当我没有在其他任何地方加入它时，我收到一条错误，上面写着“ks is not defined”。当我在ks中加入depfuncs时，这就是错误：

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Python26\Code\gppp.py", line 459, in <module>
    job_server.submit(reify, (pop1, pop2, 1000), depfuncs = (key_seq, ks, Chromosome, Params, Node, Tree), modules = ("math",), callback = sum.add, globals = globals())
  File "C:\Python26\lib\site-packages\pp.py", line 449, in submit
    sfunc = self.__dumpsfunc((func, ) + depfuncs, modules)
  File "C:\Python26\lib\site-packages\pp.py", line 634, in __dumpsfunc
    sources = [self.__get_source(func) for func in funcs]
  File "C:\Python26\lib\site-packages\pp.py", line 713, in __get_source
    sourcelines = inspect.getsourcelines(func)[0]
  File "C:\Python26\lib\inspect.py", line 678, in getsourcelines
    lines, lnum = findsource(object)
  File "C:\Python26\lib\inspect.py", line 519, in findsource
    file = getsourcefile(object) or getfile(object)
  File "C:\Python26\lib\inspect.py", line 441, in getsourcefile
    filename = getfile(object)
  File "C:\Python26\lib\inspect.py", line 418, in getfile
    raise TypeError('arg is not a module, class, method, '
TypeError: arg is not a module, class, method, function, traceback, frame, or code object

我很确定arg指的是ks。那么，我在哪里可以告诉.submit() ks？我不明白应该去哪里。感谢。

Answer 1

有趣的是 - 你在进行遗传学模拟吗？我问，因为我在那里看到'染色体'，我曾经使用并行python开发了一个群体遗传模拟。

你的方法看起来很复杂。在我的并行python程序中，我使用了以下调用：

job = jobServer.submit( doRun, (param,))

我是怎么逃避这个的？诀窍是doRun函数不会在与调用sumbit的上下文相同的上下文中运行。例如（人为的例子）：

import os, pp

def doRun(param):
    print "your name is %s!" % os.getlogin()

jobServer = pp.Server()
jobServer.submit( doRun, (param,))

此代码将失败。这是因为doRun中不存在os模块 - doRun不在与submit相同的上下文中运行。确定，您可以在os的{{1}}参数中传递module，但是在doRun中调用submit是不是更容易？

parallel python试图通过在一个完全独立的进程中运行你的函数来避免python的GIL。它试图通过让你引用“传递”参数和命名空间到你的函数来使这更容易吞下，但它使用hacks来做到这一点。例如，您的类将使用import os的某个变体进行序列化，然后在新进程中进行反序列化。

但是，不要依赖于pickle的黑客，只要接受你的功能需要完成设置它的运行上下文的所有工作的现实。你真的有两个submit函数 - 一个用于设置对main的调用，另一个用于通过submit调用，它实际上设置了你需要做的工作。

如果您需要生成器的下一个值可用于pp运行，也可以将其作为参数传递！这避免了lambda函数和生成器引用，并让你传递一个简单的变量！

我的代码不再维护，但如果你好奇，请查看： http://pps-spud.uchicago.edu/viewvc/fps/trunk/python/fps.py?view=markup

Answer 2

我认为你应该传递lambda：ks.next（）而不是普通的旧ks

并行Python：如何为'submit'提供参数？

2 个答案: