我正在编写一个Python脚本(使用Python 3.2),在某些时候需要通过一个大约800.000行的文件来为字典中的每个键。键的数量约为150.000。文件中的行是以下格式的字典:
{'url': 'http://address.com/document/42/1998', 'referrer': 'http://address.com/search?&q=query1', 'session': '1', 'rank': 2, 'time': 1338447254}
{'url': 'http://address.com/document/55/17', 'referrer': 'http://address.com/search&q=query2', 'session': '1', 'rank': 2, 'time': 13384462462}
对于此文件中的每一行,我需要进行一些计算并存储结果。为了能够阅读字典并对其进行处理,我使用了eval。这将导致对eval的120.000.000.000次调用,这需要很长时间。因此,我正在寻找一种优化方法。
欢迎您提供所有可能的优化建议。每一点都可能产生影响,但我主要对eval以及我读取文件的方式感兴趣。自动取款机。我认为eval可能执行得更快的其他一些方法,但是我不能让JSON读取格式并使用split还没有结果。 我也可以优化从文件中读取的方式。我已经尝试过以下代码中的方法,以及“with”(速度慢得多,但消耗的内存更少)。我还尝试使用map:
在内存中读取文件f_chunk = map(eval, codecs.open(chunk_file, "r", encoding="utf-8").readlines())
但这也不起作用。
无论如何,脚本的以下部分是沉重的。它在多个过程中运行:
def mine(id, tmp_sessions, chunk_file, work_q, result_q, init_qsize):
#f_chunk = map(eval, codecs.open(chunk_file, "r", encoding="utf-8").readlines())
f_chunk = codecs.open(chunk_file, "r", encoding="utf-8").readlines()
while True:
try:
k = work_q.get()
if k == 'STOP':
work_q.task_done()
break # reached end of queue
except Queue.Empty:
break
#with codecs.open(chunk_file, "r", encoding="utf-8") as f_chunk:
for line in f_chunk:
#try:
jlog_nest = dict()
jlog_nest = eval(line)
#jlog_nest = json.loads(line)
#jlog_nest = line
#jlog_nest = defaultdict(line)
if jlog_nest["session"] == k: # If session is the same
query_nest = prepare_test_cases_lib.extract_query(jlog_nest["referrer"])
for q in tmp_sessions[k]:
if q[0] == query_nest:
url = jlog_nest["url"]
rank = jlog_nest["rank"]
doc_id = prepare_test_cases_lib.extract_document_id(url)
# Increase number of hits on that document, and save its rank
if doc_id in q[1]:
q[1][doc_id][0] += 1
q[1][doc_id][1].append(rank)
else:
q[1][doc_id] = [1, [rank]]
#except:
# print ("error",k)
result_q.put((k, tmp_sessions[k]))
work_q.task_done()
如果在运行上述代码之前有助于理解tmp_session可能会发生什么:
tmp_sessions: {'39': [['q7', {}], ['q2', {}]], '40': [['q2', {}]]}
之后:
tmp_sessions: {'39': [['q7', {}], ['q2', {'133378': [1, [2]]}]], '40': [['q2', {'133378': [1, [2]]}]]}
在真实数据的一个子集上,文件中有562个键和2232行我运行pstats,按时间降序排序(这只是顶部):
1284892 function calls in 76.810 seconds
Ordered by: cumulative time
ncalls tottime percall cumtime percall filename:lineno(function)
8 0.000 0.000 77.985 9.748 {built-in method exec}
8 1.607 0.201 77.978 9.747 prepare_hard_test_cases.py:29(mine)
1254384 75.051 0.000 76.220 0.000 {built-in method eval}
562 0.008 0.000 0.050 0.000 queues.py:99(put)
8 0.000 0.000 0.029 0.004 codecs.py:685(readlines)
从这看起来它似乎确实需要花费时间。
编辑:正如我所建议的那样,我尝试使用literal_eval。我实际上发现这试图找到一个解决方案,但认为它将与eval相同。我跑了。它确实产生了相同的结果,但运行时间非常糟糕:
50205868 function calls (37662028 primitive calls) in 121.494 seconds
Ordered by: cumulative time
ncalls tottime percall cumtime percall filename:lineno(function)
8 0.001 0.000 121.494 15.187 {built-in method exec}
8 0.008 0.001 121.493 15.187 <string>:1(<module>)
8 4.935 0.617 121.485 15.186 prepare_hard_test_cases.py:29(mine)
1254384 5.088 0.000 116.425 0.000 ast.py:39(literal_eval)
1254384 1.098 0.000 71.432 0.000 ast.py:31(parse)
1254384 70.333 0.000 70.333 0.000 {built-in method compile}
13798224/1254384 22.996 0.000 39.336 0.000 ast.py:51(_convert)
7526304 8.539 0.000 23.042 0.000 ast.py:63(<genexpr>)
25087680 8.371 0.000 8.371 0.000 {built-in method isinstance}
8 0.001 0.000 0.047 0.006 codecs.py:685(readlines)
编辑2:我现在尝试了两种新方法。第一个是通过从每一行手动提取键和值,构建一个字典来处理。这在我的测试集上运行得快一点:
51460252 function calls in 45.207 seconds
Ordered by: cumulative time
ncalls tottime percall cumtime percall filename:lineno(function)
8 0.001 0.000 45.207 5.651 {built-in method exec}
8 0.003 0.000 45.207 5.651 <string>:1(<module>)
8 1.701 0.213 45.203 5.650 prepare_hard_test_cases.py:68(mine)
1254384 5.725 0.000 43.391 0.000 prepare_hard_test_cases.py:36(extractDict)
6271920 23.433 0.000 37.665 0.000 prepare_hard_test_cases.py:20(extractKeyValue)
18819074 11.308 0.000 11.308 0.000 {method 'find' of 'str' objects}
25092651 2.927 0.000 2.927 0.000 {built-in method len}
这是个好消息,但更好的是我使用泡菜的第二种方法。现在我明白了:
30091 function calls in 5.285 seconds
Ordered by: cumulative time
ncalls tottime percall cumtime percall filename:lineno(function)
8 0.000 0.000 5.285 0.661 {built-in method exec}
8 0.003 0.000 5.285 0.661 <string>:1(<module>)
8 0.173 0.022 5.281 0.660 prepare_hard_test_cases.py:68(mine)
570 0.001 0.000 5.057 0.009 queues.py:113(get)
2281 3.925 0.002 3.925 0.002 {method 'acquire' of '_multiprocessing.SemLock' objects}
570 1.133 0.002 1.133 0.002 {method 'recv' of '_multiprocessing.PipeConnection' objects}
8 0.029 0.004 0.029 0.004 {built-in method load}
当我得到时间时,我将尝试将此方法应用于整套。
有什么建议吗?
祝你好运, 卡斯帕
答案 0 :(得分:2)
你应该试试ast.literal_eval()
,它是专为工作而设计的,并且可能会更快。
eval()
缓慢,不安全,通常是个坏主意。如果您认为自己需要它,请浏览一下,我保证您没有99.99%的时间。
另外注意:
f_chunk = codecs.open(chunk_file, "r", encoding="utf-8").readlines()
...
应该是:
with open(chunk_file, "r", encoding="utf-8") as f_chunk:
...
文件是迭代器,因此使用readlines()
只会降低程序的内存效率。使用with
可确保您的文件在完成后正常关闭(因为您在3.x中,因为它已更新以支持其他功能,因此您可以使用open()
代替codecs.open()
后者)。
除此之外,据我所知,您的数据的每一行都应该是有效的JSON,因此json
模块也应该有用。