Question

我不确定默认的python安装是否是我一直在安装模块的安装，如果这可能是导致Unicode字节大小兼容性错误的原因。简而言之，我使用Python 2.7.3安装了Numpy 1.7，当我尝试安装使用Python和Numpy作为依赖项的其他程序时，我收到此错误：

Traceback (most recent call last):
  File "setup.py", line 20, in <module>
    from weblogolib import __version__
  File "/home/chris/Documents/IS/Bioinformatics-Software/weblogo-3.3/weblogolib/__init__.py", line 108, in <module>
    from numpy import array, asarray, float64, ones, zeros, int32,all,any, shape
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
import add_newdocs
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
from numpy.lib import add_newdoc
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
from type_check import *
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
import numpy.core.numeric as _nx
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString

所以我猜我有一个冲突的unicode字节大小（2字节对4字节）。我去看看我是否有相互矛盾的Python版本可能会弄乱这个。

python --version
Python 2.7.3

但这似乎与

不一致

which python
/usr/local/bin/python

当我转到/usr/local/bin时，我发现这些文件（与python相关）：

python
python2
python2.7
python-config
python2-config
python2.7-config

现在我已将numpy安装到/usr/lib/python2.7/dist-packages的dist-packages目录中，该目录对应于python --version的内容。但是当我尝试which python并获取python而不是python2.7的目录这一事实让我担心，当我尝试安装使用python和numpy作为依赖项的程序时，这可能会有冲突。

所以我想澄清我的问题：这些普通文件是否可以找到python安装或者我以某种方式安装了三个不同的版本？他们会用无法识别的符号导致我的错误吗？如果它们确实是无关的版本，有没有办法卸载？

感谢您提供的任何帮助！

哦，这是我之前的一个问题的链接，我在编辑PYTHONPATH的同时尝试修复我遇到的ImportError，如果这可能会影响事情...... ImportError: No module named numpy

以下是尝试virtualenv的结果：

chris@ubuntu:~/Documents/IS/Bioinformatics-Software$ virtualenv weblogo-3.3
New python executable in weblogo-3.3/bin/python
Installing setuptools.............done.
Installing pip...............done.
chris@ubuntu:~/Documents/IS/Bioinformatics-Software$ cd weblogo-3.3
chris@ubuntu:~/Documents/IS/Bioinformatics-Software/weblogo-3.3$ source bin/activate
(weblogo-3.3)chris@ubuntu:~/Documents/IS/Bioinformatics-Software/weblogo-3.3$ pip install numpy
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): numpy in /usr/lib/python2.7/dist-packages
Cleaning up...

Answer 1

问题确实似乎与Python和Numpy编译设置不匹配。

/ usr / local / bin是安装自定义Python的地方，你应该尝试使用/ usr / bin / python运行。

另一个解决方案是使用virtualenv。试试这个：

virtualenv myproject
cd myproject
source bin/activate
pip install numpy

基本上，virtualenv在“myproject”目录中使用自己的包设置不同的Python安装。运行“activate”命令会告诉系统您要使用此安装而不是默认系统。这使您可以为不同的项目提供不同的Python环境。使用virtualenv，每个项目都可以拥有自己的Python包版本，即使它们与其他项目或系统包不兼容。

请注意，每次打开新shell并希望使用该虚拟环境时，都必须重复“source”命令。此外，您可能必须使用OS包管理器安装virtualenv命令。如果无法做到这一点（例如您没有超级用户权限）或者您的操作系统版本由于某种原因而过时，您也可以从https://pypi.python.org/packages/source/v/virtualenv/手动下载

如果你执行ls -l / usr / local / bin / python *你应该看到python和python2实际上是python2.7的符号链接，同样python-config和python2-config是python2.7-config的符号链接

Answer 2

你在做什么操作系统？这对超级用户来说更像一个问题，但尝试这样的事情。如果您还没有，请选择easy_install并使用pip。

在Ubuntu上：

sudo apt-get install python-setuptools 
sudo easy_install pip 
pip install --user numpy

可能存在冲突的python安装

2 个答案: