Question

我想评估一些代码在不同版本的R中的性能。原则上这很容易：

开始R
使用system.time()来衡量运行一段代码所需的时间
终止R
以不同的版本冲洗并重复

现在，我想使用knitr创建报告来执行此操作。所以，在我看来，我需要一种机制来在每个块中启动一个新的会话。

我该怎么做？

一些示例knitr降价代码用作演示。此代码使用ggplot绘制图形，但显然两个版本都返回相同的时序，因为我不知道如何为每个块启动新版本的R。

Comparison of R performance
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# Do analysis in R version 2.14

```{r fig.width=6, fig.height=3}
library(ggplot2)
data(diamonds)

system.time({
  p <- ggplot(diamonds, aes(carat, price/carat, colour=clarity)) + geom_point()
  print(p)
})
```


# Repeat same analysis in R 2.15

```{r fig.width=6, fig.height=3}
library(ggplot2)
data(diamonds)

system.time({
  p <- ggplot(diamonds, aes(carat, price/carat, colour=clarity)) + geom_point()
  print(p)
})
```

Answer 1

在Rscript was easy中添加knitr引擎，但我被an R bug阻止了。无论如何，这个引擎自version 1.1.5起可用，并将在CRAN上作为版本1.2。

现在您可以指定块选项engine='Rscript'和engine.path='path/to/the/desired/Rscript'。

对于大规模的性能比较，我认为Ari B. Friedman在上述评论中提出的建议是一种更好的方法。如果您有许多用于比较的代码块，则输入引擎路径将非常繁琐。

如何使用knitr来比较不同版本R的性能？

1 个答案: