当一些数字包含逗号作为千位分隔符时如何读取数据?

时间:2009-10-06 00:55:22

标签: r csv r-faq

我有一个csv文件,其中一些数值表示为字符串,逗号为千位分隔符,例如"1,513"代替1513。将数据读入R的最简单方法是什么?

我可以使用read.csv(..., colClasses="character"),但是在将这些列转换为数字之前,我必须从相关元素中删除逗号,而且我找不到一种巧妙的方法来执行此操作。

11 个答案:

答案 0 :(得分:129)

不确定如何正确解释read.csv,但您可以使用gsub","替换为"",然后将字符串转换为{{1使用numeric

as.numeric

这是also answered previously on R-Help(以及Q2 here)。

或者,您可以预处理文件,例如在unix中使用y <- c("1,200","20,000","100","12,111") as.numeric(gsub(",", "", y)) # [1] 1200 20000 100 12111

答案 1 :(得分:55)

您可以半自动read.table或read.csv为您执行此转换。首先创建一个新的类定义,然后创建一个转换函数,并使用setAs函数将其设置为“as”方法,如下所示:

setClass("num.with.commas")
setAs("character", "num.with.commas", 
        function(from) as.numeric(gsub(",", "", from) ) )

然后运行read.csv,如:

DF <- read.csv('your.file.here', 
   colClasses=c('num.with.commas','factor','character','numeric','num.with.commas'))

答案 2 :(得分:16)

我想使用R而不是预处理数据,因为它可以在修改数据时更轻松。根据Shane关于使用gsub的建议,我认为这与我能做的一样整洁:

x <- read.csv("file.csv",header=TRUE,colClasses="character")
col2cvt <- 15:41
x[,col2cvt] <- lapply(x[,col2cvt],function(x){as.numeric(gsub(",", "", x))})

答案 3 :(得分:12)

这个问题已有几年了,但我偶然发现了,这意味着其他人也会这样。

readr库/包有一些不错的功能。其中一个是解释“凌乱”列的好方法,就像这些。

library(readr)
read_csv("numbers\n800\n\"1,800\"\n\"3500\"\n6.5",
          col_types = list(col_numeric())
        )

这会产生

来源:本地数据框[4 x 1]

  numbers
    (dbl)
1   800.0
2  1800.0
3  3500.0
4     6.5

阅读文件时的一个重点:您必须预处理,例如上面关于sed的评论,或者您必须在阅读时处理。通常,如果你试图在事后解决问题,那么很难找到一些危险的假设。 (这就是为什么平面文件首先是如此邪恶的原因。)

例如,如果我没有标记col_types,我会得到这个:

> read_csv("numbers\n800\n\"1,800\"\n\"3500\"\n6.5")
Source: local data frame [4 x 1]

  numbers
    (chr)
1     800
2   1,800
3    3500
4     6.5

(请注意,它现在是chrcharacter),而不是numeric。)

或者,更危险的是,如果它足够长并且大部分早期元素都不包含逗号:

> set.seed(1)
> tmp <- as.character(sample(c(1:10), 100, replace=TRUE))
> tmp <- c(tmp, "1,003")
> tmp <- paste(tmp, collapse="\"\n\"")

(这样最后几个元素看起来像:)

\"5\"\n\"9\"\n\"7\"\n\"1,003"

然后你会发现读这个逗号的麻烦了!

> tail(read_csv(tmp))
Source: local data frame [6 x 1]

     3"
  (dbl)
1 8.000
2 5.000
3 5.000
4 9.000
5 7.000
6 1.003
Warning message:
1 problems parsing literal data. See problems(...) for more details. 

答案 4 :(得分:6)

R:

中的“预处理”
lines <- "www, rrr, 1,234, ttt \n rrr,zzz, 1,234,567,987, rrr"

可以在readLines上使用textConnection。然后只删除数字之间的逗号:

gsub("([0-9]+)\\,([0-9])", "\\1\\2", lines)

## [1] "www, rrr, 1234, ttt \n rrr,zzz, 1234567987, rrr"

知道但不直接与此问题相关的有用的是,逗号作为小数分隔符可以由read.csv2(自动)或read.table(设置'dec'参数)处理。

编辑:后来我发现了如何通过设计一个新类来使用colClasses。参见:

How to load df with 1000 separator in R as numeric class?

答案 5 :(得分:6)

使用dplyr和管道

mutate_all解决方案

说你有以下内容:

> dft
Source: local data frame [11 x 5]

   Bureau.Name Account.Code   X2014   X2015   X2016
1       Senate          110 158,000 211,000 186,000
2       Senate          115       0       0       0
3       Senate          123  15,000  71,000  21,000
4       Senate          126   6,000  14,000   8,000
5       Senate          127 110,000 234,000 134,000
6       Senate          128 120,000 159,000 134,000
7       Senate          129       0       0       0
8       Senate          130 368,000 465,000 441,000
9       Senate          132       0       0       0
10      Senate          140       0       0       0
11      Senate          140       0       0       0

并希望从年变量X2014-X2016中删除逗号,以及 将它们转换为数字。另外,让我们说X2014-X2016被读入 因素(默认)

dft %>%
    mutate_all(funs(as.character(.)), X2014:X2016) %>%
    mutate_all(funs(gsub(",", "", .)), X2014:X2016) %>%
    mutate_all(funs(as.numeric(.)), X2014:X2016)

mutate_allfuns内的函数应用于指定的列

我按顺序执行,一次执行一个功能(如果使用多个功能) funs内的函数,然后你创建额外的,不必要的列)

答案 6 :(得分:4)

如果数字以“。”分隔。调用gsub时,“,”(1.200.000,00)的小数点为set fixed=TRUE as.numeric(gsub(".","",y,fixed=TRUE))

答案 7 :(得分:2)

我认为预处理是可行的方法。您可以使用具有正则表达式替换选项的Notepad++

例如,如果您的文件是这样的:

"1,234","123","1,234"
"234","123","1,234"
123,456,789

然后,您可以使用正则表达式"([0-9]+),([0-9]+)"并将其替换为\1\2

1234,"123",1234
"234","123",1234
123,456,789

然后您可以使用x <- read.csv(file="x.csv",header=FALSE)来读取文件。

答案 8 :(得分:2)

一种非常方便的方式是readr::read_delim - 家庭。以这里为例:   Importing csv with multiple separators into R您可以按照以下方式执行此操作:

txt <- 'OBJECTID,District_N,ZONE_CODE,COUNT,AREA,SUM
1,Bagamoyo,1,"136,227","8,514,187,500.000000000000000","352,678.813105723350000"
2,Bariadi,2,"88,350","5,521,875,000.000000000000000","526,307.288878142830000"
3,Chunya,3,"483,059","30,191,187,500.000000000000000","352,444.699742995200000"'

require(readr)
read_csv(txt) # = read_delim(txt, delim = ",")

这导致了预期的结果:

# A tibble: 3 × 6
  OBJECTID District_N ZONE_CODE  COUNT        AREA      SUM
     <int>      <chr>     <int>  <dbl>       <dbl>    <dbl>
1        1   Bagamoyo         1 136227  8514187500 352678.8
2        2    Bariadi         2  88350  5521875000 526307.3
3        3     Chunya         3 483059 30191187500 352444.7

答案 9 :(得分:0)

使用read_delim函数(该函数是 reader 库的一部分),您可以指定其他参数:

locale = locale(decimal_mark = ",")

read_delim("filetoread.csv", ';", locale = locale(decimal_mark = ","))

*第二行中的分号表示read_delim将读取csv分号分隔的值。

这将有助于读取所有带有逗号的数字作为正确的数字。

致谢

Mateusz Kania

答案 10 :(得分:0)

我们也可以使用readr::parse_number,尽管列必须是字符。如果我们想将其应用于多列,我们可以使用lapply

遍历各列
df[2:3] <- lapply(df[2:3], readr::parse_number)
df

#  a        b        c
#1 a    12234       12
#2 b      123  1234123
#3 c     1234     1234
#4 d 13456234    15342
#5 e    12312 12334512

或使用mutate_at中的dplyr将其应用于特定变量。

library(dplyr)
df %>% mutate_at(2:3, readr::parse_number)
#Or
df %>% mutate_at(vars(b:c), readr::parse_number)

数据

df <- data.frame(a = letters[1:5], 
                 b = c("12,234", "123", "1,234", "13,456,234", "123,12"),
                 c = c("12", "1,234,123","1234", "15,342", "123,345,12"), 
                 stringsAsFactors = FALSE)