如何用RDFLib解析.ttl文件?

时间:2013-03-02 07:03:37

标签: python python-2.7 parsing turtle-rdf

我有一个.ttl形式的文件。它有4个属性/列,包含以下形式的四元组:

  1. (id, student_name, student_address, student_phoneno)
  2. (id, faculty_name, faculty_address, faculty_phoneno)
  3. 我知道如何用RDFLib解析.n3格式三元组;

    from rdflib import Graph
    g = Graph()
    g.parse("demo.nt", format="nt")
    

    但我不确定如何解析这些四重奏。

    我的目的是解析并提取与特定id有关的所有信息。学生和教师的身份证可以相同。

    如何使用RDFLib处理这些四元组并将其用于基于id的聚合?

    来自.ttl文件的示例摘录:

    #@ <id1>
    <Alice> <USA> <12345>
    
    #@ <id1>
    <Jane> <France> <78900>
    

4 个答案:

答案 0 :(得分:8)

TurtleNotation 3语法的子集,因此rdflib应该能够使用format='n3'对其进行解析。 检查rdflib是否保留了评论(id是否在您的示例中的评论(#...)中指定了。如果没有,输入格式就像示例中所示的那样简单,那么您可以手动解析它:

import re
from collections import namedtuple
from itertools import takewhile

Entry = namedtuple('Entry', 'id name address phone')

def get_entries(path):
    with open(path) as file:
        # an entry starts with `#@` line and ends with a blank line
        for line in file:
            if line.startswith('#@'):
                buf = [line]
                buf.extend(takewhile(str.strip, file)) # read until blank line
                yield Entry(*re.findall(r'<([^>]+)>', ''.join(buf)))

print("\n".join(map(str, get_entries('example.ttl'))))

输出:

Entry(id='id1', name='Alice', address='USA', phone='12345')
Entry(id='id1', name='Jane', address='France', phone='78900')

将条目保存到db:

import sqlite3

with sqlite3.connect('example.db') as conn:
    conn.execute('''CREATE TABLE IF NOT EXISTS entries
             (id text, name text, address text, phone text)''')
    conn.executemany('INSERT INTO entries VALUES (?,?,?,?)',
                     get_entries('example.ttl'))

如果您需要在Python中进行一些后处理,则按ID进行分组:

import sqlite3
from itertools import groupby
from operator import itemgetter

with sqlite3.connect('example.db') as c:
    rows = c.execute('SELECT * FROM entries ORDER BY id LIMIT ?', (10,))
    for id, group in groupby(rows, key=itemgetter(0)):
        print("%s:\n\t%s" % (id, "\n\t".join(map(str, group))))

输出:

id1:
    ('id1', 'Alice', 'USA', '12345')
    ('id1', 'Jane', 'France', '78900')

答案 1 :(得分:1)

看起来至少从 rdflib 5.0.0 开始支持turtle。我做过

from rdflib import Graph
graph = Graph()
graph.parse('myfile.ttl', format='ttl')

这解析得很好。

答案 2 :(得分:0)

目前似乎没有这样的库来解析Turtle - Terse RDF Triple Language

正如您已经知道的语法,最好的办法是使用PyParsing首先创建一个语法然后解析文件。

我还建议根据您的需要调整以下EBNF implementation

答案 3 :(得分:0)

你可以像Snakes和Coffee建议的那样,只在带有yield语句的循环中包装该函数(或其代码)。这会创建一个生成器,可以迭代调用它来动态创建下一行的序列。假设您要将这些写入csv,例如,使用Snakes的parse_to_dict:

import re
import csv

writer = csv.DictWriter(open(outfile, "wb"), fieldnames=["id", "name", "address", "phone"])
# or whatever

您可以将生成器创建为函数或使用内联理解:

def dict_generator(lines): 
    for line in lines: 
        yield parse_to_dict(line)

- 或 -

dict_generator = (parse_to_dict(line) for line in lines)

这些非常相同。此时你可以通过调用dict_generator.next()得到一个dict解析的行,你可以一次神奇地得到一行 - 不会涉及额外的RAM抖动。

如果您有16个原始数据,您可以考虑使用生成器来拉入线路。他们真的很有用。

有关SO和某些文档的生成器的更多信息: What can you use Python generator functions for? http://wiki.python.org/moin/Generators