用于将脚本应用于子文件夹并相应地命名结果的循环--R

时间:2013-02-26 17:14:31

标签: r loops path subdirectory

我有一个脚本可以将test-results.csv文件的corssproduct与任何现有的列车.csv文件放在一个文件夹中

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mytest <- function(data) {
data01 <- as.matrix(read.csv(file = "test/test-results.csv", sep = ",", header=FALSE))
data02 <- as.matrix(read.csv(file = data, sep = ",", header=FALSE))
test <- list()
test01<- list()
test02<- list()
i<- 1
while (i <= 25){
    test01[[i]] <- c(data01[i,  ])
    test02[[i]] <- c(data02[i,  ])
    test[[i]]<- crossprod(test01[[i]],test02[[i]])
    i <- i+1
}
return(mytest)
}
result <- lapply(list.files(pattern='^tain.*\\.csv', recursive=TRUE, full.names = TRUE),test)
for (i in seq(length(result))) {
 write.csv(do.call(cbind,result),'result.csv', row.names = FALSE) 
}

我有几个具有相同结构的文件夹

Main|experiment 01|test|test-results.csv, train01.csv, train02.csv, train03.csv
Main|experiment 02|test|test-results.csv, train01.csv, train02.csv

我现在想要创建一个脚本,如果可能的话,将相同的脚本应用于所有这些文件夹并返回结果(例如results-experiment01.csv),而不是将它们应用100次

对不起,如果这看起来太可怕了......新的R

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

我们可以通过简单dirlist.files调用recursive = TRUE来获取文件列表作为字符向量(如下例所示dirlist

> dirlist
[1] "Main/experiment 01/test/a.csv"  "Main/experiment 02/test/b.csv"  "Main/experiment 02/test/d.txt"  "Main/experiment 02/dummy/a.csv"
[5] "temp1.csv"                      "Main/temp2.csv"  

您可以使用正则表达式对此向量进行子集,如下所示

> csvfiles <- dirlist[grepl('.*(experiment [0-9]+)/test/.*\\.csv', dirlist)]
> csvfiles
[1] "Main/experiment 01/test/a.csv" "Main/experiment 02/test/b.csv"

然后,您可以再次使用正则表达式获取结果名称。

> resultsnames <-  paste('result_', gsub('.*(experiment [0-9]+)/test/.*\\.csv','\\1', csvfiles), sep="")
> resultsnames
[1] "result_experiment 01" "result_experiment 02"