绘制不同类型的条形图ggplot

Question

我正在尝试绘制此data

的条形图

我到目前为止写的R脚本如下：

library(ggplot2)
f<-read.table("Coverage_test", sep="\t", header=TRUE)
f$Coverage <- factor(f$Coverage, levels=unique(as.character(f$Coverage)))
g = ggplot(data=f, aes(x=Coverage, y=Variable_counts, group=Form, fill=Type)) 
+ geom_bar(position="dodge", stat="identity", colour="black") 
+ facet_grid( ~ Sample_name, scales="free") + opts(title = "Coverage", axis.text.x = theme_text(angle = 90, hjust = 1, size = 8, colour = "grey50")) 
+ ylab("Number of variables") + scale_fill_hue() + scale_y_continuous(formatter="comma")
ggsave("Figure_test_coverage.pdf")

此代码的输出如下：

我的问题是： 有没有办法显示基于图的两个变量的行为差异。每个x轴变量有四个条。我已经选择用'Type'填充颜色，这表明我的数据中'Type'（一个变量）的行为有多么不同。但我还想展示变量'Form'在我的数据中的表现。我已将它们分组在我的代码'group = Form'中，但无法在实际图形中进行区分（视觉上）。这可以通过显示一个变量的不同颜色和另一个变量的不同线型（实线和虚线）在线图中完成。如下所示： 。

我想知道'Form'变量是否可以用不同的颜色显示，或者至少可以在它们各自的条形图或任何可能的东西下面命名？ 非常感谢任何帮助。

谢谢。

Answer 1

我想你想要这样的东西：

ggplot(data=dat, aes(x=Coverage, 
                        y=Variable_counts, 
                         group=interaction(Form,Type), 
                         fill=interaction(Form,Type))) +
 geom_bar(position="dodge", stat="identity", colour="black")

修改

在这里，我会因为条形图和samrt公式表示法而格子化。为了好玩，我使用像latticeExtra这样的ggplot主题。

library(latticeExtra)
barchart(Variable_counts~Coverage|Sample_name,
         groups=interaction(Type,Form),
         data=dat,stack=F,auto.key=list(columns = 4),
         par.settings = ggplot2like(),
         axis = axis.grid,
         between=list(x=2))