删除文件中空列的最快方法是什么。下面给出了一个示例文件。
我使用了python'pandas'软件包,但是花了太多时间(大约10分钟后我没有得到答案,因此我必须为许多文件执行此操作)以加载我的2 GB文件。 / p>
df = read_table(inFileName, sep="\t")
df = df.dropna(axis=1,how='all') #remove columns
aaa bbb ccc ddd eee
1 a c
2 s d
3 d
f d
4 g d
5 h e
我事先并不知道哪些字段是空的。 我正在使用0.9.1版本的'pandas'
pkg_resources.get_distribution( “熊猫”)。版本 '0.9.1'
答案 0 :(得分:2)
嗯,我猜你发现你真的不想删除那些列。但是,您可以在gawk
中完成此操作。
awk -F "\t" 'ARGIND==1{
for(i=1;i<=NF;i++)n[i]+=$i!=""
}ARGIND==2{
if(!ok){for(i in n)if(!n[i])delete n[i];asorti(n);ok=1}
for(i in n)printf("%s\t",$n[i]);printf("\n")
}' input.txt{,} > output.txt
这可以通过在文件中进行两次传递来实现。第一个计算每列中的条目数,而第二个仅打印那些至少有一个匹配的列。对于您的示例文件(假设以制表符分隔的列,并删除aaa bbb等标题,我得到结果
1 a c
2 s d
3 d
f d
4 g d
5 h e
但是,2 GB的文本文件。你有没有更合适的二进制格式来存储它?