从数据框中删除重复列的最简单方法是什么?
我正在通过以下方式阅读包含重复列的文本文件:
import pandas as pd
df=pd.read_table(fname)
列名是:
Time, Time Relative, N2, Time, Time Relative, H2, etc...
所有时间和时间相对列包含相同的数据。我想要:
Time, Time Relative, N2, H2
我尝试删除,删除等所有内容,例如:
df=df.T.drop_duplicates().T
导致唯一值索引错误:
Reindexing only valid with uniquely valued index objects
对不起是熊猫菜鸟。任何建议将不胜感激。
其他详细信息
熊猫版:0.9.0
Python版本:2.7.3
Windows 7
(通过Pythonxy 2.7.3.0安装)
数据文件(注意:在真实文件中,列由制表符分隔,此处它们用4个空格分隔):
Time Time Relative [s] N2[%] Time Time Relative [s] H2[ppm]
2/12/2013 9:20:55 AM 6.177 9.99268e+001 2/12/2013 9:20:55 AM 6.177 3.216293e-005
2/12/2013 9:21:06 AM 17.689 9.99296e+001 2/12/2013 9:21:06 AM 17.689 3.841667e-005
2/12/2013 9:21:18 AM 29.186 9.992954e+001 2/12/2013 9:21:18 AM 29.186 3.880365e-005
... etc ...
2/12/2013 2:12:44 PM 17515.269 9.991756+001 2/12/2013 2:12:44 PM 17515.269 2.800279e-005
2/12/2013 2:12:55 PM 17526.769 9.991754e+001 2/12/2013 2:12:55 PM 17526.769 2.880386e-005
2/12/2013 2:13:07 PM 17538.273 9.991797e+001 2/12/2013 2:13:07 PM 17538.273 3.131447e-005
答案 0 :(得分:231)
上述所有内容似乎都是不必要的沉重而繁琐的方法 - 这是解决问题的一线解决方案。如果某些列名称重复并且您希望将其删除,则这适用:
df = df.loc[:,~df.columns.duplicated()]
假设数据框的列为['alpha','beta','alpha']
df.columns.duplicated()
返回一个布尔数组:每列True
或False
。如果是False
,那么列名在此之前是唯一的,如果它是True
,则列名称会先重复。例如,使用给定的示例,返回的值将为[False,False,True]
。
Pandas
允许使用布尔值进行索引,从而仅选择True
值。由于我们要保留不重复的列,我们需要翻转上面的布尔数组(即[True, True, False] = ~[False,False,True]
)
最后,df.loc[:,[True,True,False]]
使用上述索引功能仅选择非重复列。
注意:以上只检查列名,不列值。
答案 1 :(得分:37)
听起来你已经知道了唯一的列名。如果是这种情况,那么df = df['Time', 'Time Relative', 'N2']
就可以了。
如果没有,您的解决方案应该有效:
In [101]: vals = np.random.randint(0,20, (4,3))
vals
Out[101]:
array([[ 3, 13, 0],
[ 1, 15, 14],
[14, 19, 14],
[19, 5, 1]])
In [106]: df = pd.DataFrame(np.hstack([vals, vals]), columns=['Time', 'H1', 'N2', 'Time Relative', 'N2', 'Time'] )
df
Out[106]:
Time H1 N2 Time Relative N2 Time
0 3 13 0 3 13 0
1 1 15 14 1 15 14
2 14 19 14 14 19 14
3 19 5 1 19 5 1
In [107]: df.T.drop_duplicates().T
Out[107]:
Time H1 N2
0 3 13 0
1 1 15 14
2 14 19 14
3 19 5 1
你可能有一些特定于你的数据的东西弄乱了它。如果您可以向我们提供有关数据的更多详细信息,我们可以提供更多帮助。
修改强> 就像Andy所说,问题可能在于重复的列标题。
对于我编写的示例表文件'dummy.csv':
Time H1 N2 Time N2 Time Relative
3 13 13 3 13 0
1 15 15 1 15 14
14 19 19 14 19 14
19 5 5 19 5 1
使用read_table
可以提供唯一的列并且可以正常运行:
In [151]: df2 = pd.read_table('dummy.csv')
df2
Out[151]:
Time H1 N2 Time.1 N2.1 Time Relative
0 3 13 13 3 13 0
1 1 15 15 1 15 14
2 14 19 19 14 19 14
3 19 5 5 19 5 1
In [152]: df2.T.drop_duplicates().T
Out[152]:
Time H1 Time Relative
0 3 13 0
1 1 15 14
2 14 19 14
3 19 5 1
如果您的版本不允许您使用,您可以将解决方案混合在一起以使其独一无二:
In [169]: df2 = pd.read_table('dummy.csv', header=None)
df2
Out[169]:
0 1 2 3 4 5
0 Time H1 N2 Time N2 Time Relative
1 3 13 13 3 13 0
2 1 15 15 1 15 14
3 14 19 19 14 19 14
4 19 5 5 19 5 1
In [171]: from collections import defaultdict
col_counts = defaultdict(int)
col_ix = df2.first_valid_index()
In [172]: cols = []
for col in df2.ix[col_ix]:
cnt = col_counts[col]
col_counts[col] += 1
suf = '_' + str(cnt) if cnt else ''
cols.append(col + suf)
cols
Out[172]:
['Time', 'H1', 'N2', 'Time_1', 'N2_1', 'Time Relative']
In [174]: df2.columns = cols
df2 = df2.drop([col_ix])
In [177]: df2
Out[177]:
Time H1 N2 Time_1 N2_1 Time Relative
1 3 13 13 3 13 0
2 1 15 15 1 15 14
3 14 19 19 14 19 14
4 19 5 5 19 5 1
In [178]: df2.T.drop_duplicates().T
Out[178]:
Time H1 Time Relative
1 3 13 0
2 1 15 14
3 14 19 14
4 19 5 1
答案 2 :(得分:10)
如果我没有弄错的话,下面的内容是在没有转置解决方案的内存问题的情况下进行的,并且使用比@kalu函数更少的行,保留任何类似命名列中的第一列。
Cols = list(df.columns)
for i,item in enumerate(df.columns):
if item in df.columns[:i]: Cols[i] = "toDROP"
df.columns = Cols
df = df.drop("toDROP",1)
答案 3 :(得分:9)
对于大型DataFrame,转置效率很低。这是另一种选择:
def duplicate_columns(frame):
groups = frame.columns.to_series().groupby(frame.dtypes).groups
dups = []
for t, v in groups.items():
dcols = frame[v].to_dict(orient="list")
vs = dcols.values()
ks = dcols.keys()
lvs = len(vs)
for i in range(lvs):
for j in range(i+1,lvs):
if vs[i] == vs[j]:
dups.append(ks[i])
break
return dups
像这样使用:
dups = duplicate_columns(frame)
frame = frame.drop(dups, axis=1)
修改强>
一种内存高效版本,可以像任何其他值一样处理nans:
from pandas.core.common import array_equivalent
def duplicate_columns(frame):
groups = frame.columns.to_series().groupby(frame.dtypes).groups
dups = []
for t, v in groups.items():
cs = frame[v].columns
vs = frame[v]
lcs = len(cs)
for i in range(lcs):
ia = vs.iloc[:,i].values
for j in range(i+1, lcs):
ja = vs.iloc[:,j].values
if array_equivalent(ia, ja):
dups.append(cs[i])
break
return dups
答案 4 :(得分:0)
第一步:-阅读第一行,即删除所有重复的列。
第二步:-最后只读取该列。
cols = pd.read_csv("file.csv", header=None, nrows=1).iloc[0].drop_duplicates()
df = pd.read_csv("file.csv", usecols=cols)
答案 5 :(得分:0)
我遇到了这个问题,第一个答案提供的衬里效果很好。但是,我的麻烦之处在于该列的第二个副本包含所有数据。第一份没有。
解决方案是通过切换否定运算符拆分一个数据帧来创建两个数据帧。一旦有了两个数据框,就使用lsuffix
运行了一个join语句。这样,我就可以引用并删除没有数据的列。
-E
答案 6 :(得分:0)
看起来您在正确的道路上。这是您要寻找的一线客:
df.reset_index().T.drop_duplicates().T
但是,由于没有示例数据帧会产生引用的错误消息Reindexing only valid with uniquely valued index objects
,因此很难确切说明解决问题的方法。如果恢复原始索引对您很重要,请执行以下操作:
original_index = df.index.names
df.reset_index().T.drop_duplicates().reset_index(original_index).T
答案 7 :(得分:0)
下面的方法将识别重复列,以查看最初构建数据框时出了什么问题。
dupes = pd.DataFrame(df.columns)
dupes[dupes.duplicated()]
答案 8 :(得分:0)
请注意,Gene Burinsky的答案(在编写所选答案时)保留每个重复列的第一列。要保留最后一个:
df=df.loc[:, ~df.columns[::-1].duplicated()[::-1]]
答案 9 :(得分:0)
@kalu的答案的更新,该答案使用了最新的熊猫:
def find_duplicated_columns(df):
dupes = []
columns = df.columns
for i in range(len(columns)):
col1 = df.iloc[:, i]
for j in range(i + 1, len(columns)):
col2 = df.iloc[:, j]
# break early if dtypes aren't the same (helps deal with
# categorical dtypes)
if col1.dtype is not col2.dtype:
break
# otherwise compare values
if col1.equals(col2):
dupes.append(columns[i])
break
return dupes
答案 10 :(得分:-1)