python pandas删除重复的列

时间:2013-02-20 15:49:18

标签: python pandas

从数据框中删除重复列的最简单方法是什么?

我正在通过以下方式阅读包含重复列的文本文件:

import pandas as pd

df=pd.read_table(fname)

列名是:

Time, Time Relative, N2, Time, Time Relative, H2, etc...

所有时间和时间相对列包含相同的数据。我想要:

Time, Time Relative, N2, H2

我尝试删除,删除等所有内容,例如:

df=df.T.drop_duplicates().T

导致唯一值索引错误:

Reindexing only valid with uniquely valued index objects

对不起是熊猫菜鸟。任何建议将不胜感激。


其他详细信息

熊猫版:0.9.0
Python版本:2.7.3
Windows 7
(通过Pythonxy 2.7.3.0安装)

数据文件(注意:在真实文件中,列由制表符分隔,此处它们用4个空格分隔):

Time    Time Relative [s]    N2[%]    Time    Time Relative [s]    H2[ppm]
2/12/2013 9:20:55 AM    6.177    9.99268e+001    2/12/2013 9:20:55 AM    6.177    3.216293e-005    
2/12/2013 9:21:06 AM    17.689    9.99296e+001    2/12/2013 9:21:06 AM    17.689    3.841667e-005    
2/12/2013 9:21:18 AM    29.186    9.992954e+001    2/12/2013 9:21:18 AM    29.186    3.880365e-005    
... etc ...
2/12/2013 2:12:44 PM    17515.269    9.991756+001    2/12/2013 2:12:44 PM    17515.269    2.800279e-005    
2/12/2013 2:12:55 PM    17526.769    9.991754e+001    2/12/2013 2:12:55 PM    17526.769    2.880386e-005
2/12/2013 2:13:07 PM    17538.273    9.991797e+001    2/12/2013 2:13:07 PM    17538.273    3.131447e-005

11 个答案:

答案 0 :(得分:231)

上述所有内容似乎都是不必要的沉重而繁琐的方法 - 这是解决问题的一线解决方案。如果某些列名称重复并且您希望将其删除,则这适用:

df = df.loc[:,~df.columns.duplicated()]

[update]工作原理:

假设数据框的列为['alpha','beta','alpha']

df.columns.duplicated()返回一个布尔数组:每列TrueFalse。如果是False,那么列名在此之前是唯一的,如果它是True,则列名称会先重复。例如,使用给定的示例,返回的值将为[False,False,True]

Pandas允许使用布尔值进行索引,从而仅选择True值。由于我们要保留不重复的列,我们需要翻转上面的布尔数组(即[True, True, False] = ~[False,False,True]

最后,df.loc[:,[True,True,False]]使用上述索引功能仅选择非重复列。

注意:以上只检查列名,列值。

答案 1 :(得分:37)

听起来你已经知道了唯一的列名。如果是这种情况,那么df = df['Time', 'Time Relative', 'N2']就可以了。

如果没有,您的解决方案应该有效:

In [101]: vals = np.random.randint(0,20, (4,3))
          vals
Out[101]:
array([[ 3, 13,  0],
       [ 1, 15, 14],
       [14, 19, 14],
       [19,  5,  1]])

In [106]: df = pd.DataFrame(np.hstack([vals, vals]), columns=['Time', 'H1', 'N2', 'Time Relative', 'N2', 'Time'] )
          df
Out[106]:
   Time  H1  N2  Time Relative  N2  Time
0     3  13   0              3  13     0
1     1  15  14              1  15    14
2    14  19  14             14  19    14
3    19   5   1             19   5     1

In [107]: df.T.drop_duplicates().T
Out[107]:
   Time  H1  N2
0     3  13   0
1     1  15  14
2    14  19  14
3    19   5   1

你可能有一些特定于你的数据的东西弄乱了它。如果您可以向我们提供有关数据的更多详细信息,我们可以提供更多帮助。

修改 就像Andy所说,问题可能在于重复的列标题。

对于我编写的示例表文件'dummy.csv':

Time    H1  N2  Time    N2  Time Relative
3   13  13  3   13  0
1   15  15  1   15  14
14  19  19  14  19  14
19  5   5   19  5   1

使用read_table可以提供唯一的列并且可以正常运行:

In [151]: df2 = pd.read_table('dummy.csv')
          df2
Out[151]:
         Time  H1  N2  Time.1  N2.1  Time Relative
      0     3  13  13       3    13              0
      1     1  15  15       1    15             14
      2    14  19  19      14    19             14
      3    19   5   5      19     5              1
In [152]: df2.T.drop_duplicates().T
Out[152]:
             Time  H1  Time Relative
          0     3  13              0
          1     1  15             14
          2    14  19             14
          3    19   5              1  

如果您的版本不允许您使用,您可以将解决方案混合在一起以使其独一无二:

In [169]: df2 = pd.read_table('dummy.csv', header=None)
          df2
Out[169]:
              0   1   2     3   4              5
        0  Time  H1  N2  Time  N2  Time Relative
        1     3  13  13     3  13              0
        2     1  15  15     1  15             14
        3    14  19  19    14  19             14
        4    19   5   5    19   5              1
In [171]: from collections import defaultdict
          col_counts = defaultdict(int)
          col_ix = df2.first_valid_index()
In [172]: cols = []
          for col in df2.ix[col_ix]:
              cnt = col_counts[col]
              col_counts[col] += 1
              suf = '_' + str(cnt) if cnt else ''
              cols.append(col + suf)
          cols
Out[172]:
          ['Time', 'H1', 'N2', 'Time_1', 'N2_1', 'Time Relative']
In [174]: df2.columns = cols
          df2 = df2.drop([col_ix])
In [177]: df2
Out[177]:
          Time  H1  N2 Time_1 N2_1 Time Relative
        1    3  13  13      3   13             0
        2    1  15  15      1   15            14
        3   14  19  19     14   19            14
        4   19   5   5     19    5             1
In [178]: df2.T.drop_duplicates().T
Out[178]:
          Time  H1 Time Relative
        1    3  13             0
        2    1  15            14
        3   14  19            14
        4   19   5             1 

答案 2 :(得分:10)

如果我没有弄错的话,下面的内容是在没有转置解决方案的内存问题的情况下进行的,并且使用比@kalu函数更少的行,保留任何类似命名列中的第一列。

Cols = list(df.columns)
for i,item in enumerate(df.columns):
    if item in df.columns[:i]: Cols[i] = "toDROP"
df.columns = Cols
df = df.drop("toDROP",1)

答案 3 :(得分:9)

对于大型DataFrame,转置效率很低。这是另一种选择:

def duplicate_columns(frame):
    groups = frame.columns.to_series().groupby(frame.dtypes).groups
    dups = []
    for t, v in groups.items():
        dcols = frame[v].to_dict(orient="list")

        vs = dcols.values()
        ks = dcols.keys()
        lvs = len(vs)

        for i in range(lvs):
            for j in range(i+1,lvs):
                if vs[i] == vs[j]: 
                    dups.append(ks[i])
                    break

    return dups       

像这样使用:

dups = duplicate_columns(frame)
frame = frame.drop(dups, axis=1)

修改

一种内存高效版本,可以像任何其他值一样处理nans:

from pandas.core.common import array_equivalent

def duplicate_columns(frame):
    groups = frame.columns.to_series().groupby(frame.dtypes).groups
    dups = []

    for t, v in groups.items():

        cs = frame[v].columns
        vs = frame[v]
        lcs = len(cs)

        for i in range(lcs):
            ia = vs.iloc[:,i].values
            for j in range(i+1, lcs):
                ja = vs.iloc[:,j].values
                if array_equivalent(ia, ja):
                    dups.append(cs[i])
                    break

    return dups

答案 4 :(得分:0)

第一步:-阅读第一行,即删除所有重复的列。

第二步:-最后只读取该列。

cols = pd.read_csv("file.csv", header=None, nrows=1).iloc[0].drop_duplicates()
df = pd.read_csv("file.csv", usecols=cols)

答案 5 :(得分:0)

我遇到了这个问题,第一个答案提供的衬里效果很好。但是,我的麻烦之处在于该列的第二个副本包含所有数据。第一份没有。

解决方案是通过切换否定运算符拆分一个数据帧来创建两个数据帧。一旦有了两个数据框,就使用lsuffix运行了一个join语句。这样,我就可以引用并删除没有数据的列。

-E

答案 6 :(得分:0)

看起来您在正确的道路上。这是您要寻找的一线客:

df.reset_index().T.drop_duplicates().T

但是,由于没有示例数据帧会产生引用的错误消息Reindexing only valid with uniquely valued index objects,因此很难确切说明解决问题的方法。如果恢复原始索引对您很重要,请执行以下操作:

original_index = df.index.names
df.reset_index().T.drop_duplicates().reset_index(original_index).T

答案 7 :(得分:0)

下面的方法将识别重复列,以查看最初构建数据框时出了什么问题。

dupes = pd.DataFrame(df.columns)
dupes[dupes.duplicated()]

答案 8 :(得分:0)

请注意,Gene Burinsky的答案(在编写所选答案时)保留每个重复列的第一列。要保留最后一个:

df=df.loc[:, ~df.columns[::-1].duplicated()[::-1]]

答案 9 :(得分:0)

@kalu的答案的更新,该答案使用了最新的熊猫:

def find_duplicated_columns(df):
    dupes = []

    columns = df.columns

    for i in range(len(columns)):
        col1 = df.iloc[:, i]
        for j in range(i + 1, len(columns)):
            col2 = df.iloc[:, j]
            # break early if dtypes aren't the same (helps deal with
            # categorical dtypes)
            if col1.dtype is not col2.dtype:
                break
            # otherwise compare values
            if col1.equals(col2):
                dupes.append(columns[i])
                break

    return dupes

答案 10 :(得分:-1)

通过其值删除重复列的快捷简便方法:

df = df.T.drop_duplicates()。T

更多信息:Pandas DataFrame drop_duplicates manual