的Ca data< - cut(data $ Time,breaks = seq(0,max(data $ Time)+400,400)) 通过(数据$ Oxytocin,cut,mean)
但这只适用于一个人的数据....但我有十个人有他们自己的时间和催产素数据......我怎样才能同时得到他们的平均值?而不是具有此类型输出:
cuts: (0,400]
[1] 0.7
------------------------------------------------------------
cuts: (400,800]
[1] 0.805
有没有办法可以获得这些削减的清单?
答案 0 :(得分:1)
这是使用IRanges
包的解决方案。
idx
假设您的数据格式为Time
,data
,Time
,data
,...等等。因此,它会创建索引1,3,5,...ncol(df)-1
。
ir1
是你想要的平均间隔。它的宽度为400.每个时间列(此处为第1列和第3列)从0到最大(时间)。
ir2
是间隔宽度= 1的相应时间列。
然后我得到ir1
与ir2
的重叠,它基本上告诉我ir2与ir1(我们想要的)重叠的区间,我从中计算平均值并输出{{1 }}
data.frame
对于每个idx <- seq(1, ncol(df), by=2)
o <- lapply(idx, function(i) {
ir1 <- IRanges(start=seq(0, max(df[[i]]), by=401), width=401)
ir2 <- IRanges(start=df[[i]], width=1)
t <- findOverlaps(ir1, ir2)
d <- data.frame(mean=tapply(df[[i+1]], queryHits(t), mean))
cbind(as.data.frame(ir1), d)
})
> o
# [[1]]
# start end width mean
# 1 0 400 401 0.6750000
# 2 401 801 401 0.8050000
# 3 802 1202 401 0.8750000
# 4 1203 1603 401 0.2285333
# [[2]]
# start end width mean
# 1 0 400 401 0.73508
# 2 401 801 401 0.13408
# 3 802 1202 401 0.26408
# 4 1203 1603 401 1.06408
# 5 1604 2004 401 3.06408
列,您将获得一个列表,其中包含该间隔的间隔和平均值。