R:tm Textmining包:Doc-Level元数据生成很慢

时间:2013-02-19 15:15:12

标签: performance r tm

我有一个要处理的文档列表,对于每个记录,我想将一些元数据附加到“corpus”数据结构中的文档“member”,即tm,R包生成(从文本文件中读取)

这个for-loop有效,但速度很慢, 性能似乎降低为函数f~1 / n_docs。

for (i in seq(from= 1, to=length(corpus), by=1)){
    if(opts$options$verbose == TRUE || i %% 50 == 0){
        print(paste(i, " ", substr(corpus[[i]], 1, 140), sep = " "))
    }
    DublinCore(corpus[[i]], "title") = csv[[i,10]]  
    DublinCore(corpus[[i]], "Publisher" ) = csv[[i,16]]   #institutions
}       

这可能对语料库变量有所帮助,但我不知道是什么。 但是当我把它放在一个tm_map()(类似于lapply()函数)中时,它的运行速度要快得多,但是这些更改并不是持久的:

i = 0
corpus = tm_map(corpus, function(x){
            i <<- i + 1


    if(opts$options$verbose == TRUE){
        print(paste(i, " ", substr(x, 1, 140), sep = " "))
    }

    meta(x, tag = "Heading") = csv[[i,10]]  
    meta(x, tag = "publisher" ) = csv[[i,16]] 
})

退出tm_map函数后,变量语料库有空元数据字段。它应该被填补。我还有一些与收藏有关的事情。

meta()函数的R文档说明了这一点:

     Examples:
      data("crude")
      meta(crude[[1]])
      DublinCore(crude[[1]])
      meta(crude[[1]], tag = "Topics")
      meta(crude[[1]], tag = "Comment") <- "A short comment."
      meta(crude[[1]], tag = "Topics") <- NULL
      DublinCore(crude[[1]], tag = "creator") <- "Ano Nymous"
      DublinCore(crude[[1]], tag = "Format") <- "XML"
      DublinCore(crude[[1]])
      meta(crude[[1]])
      meta(crude)
      meta(crude, type = "corpus")
      meta(crude, "labels") <- 21:40
      meta(crude)

我尝试了很多这些调用(使用var“corpus”而不是“raw”),但它们似乎不起作用。 其他人曾经似乎对类似的数据集有同样的问题(forum post from 2009,没有回应)

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

这里有一些基准测试...

使用for循环:

expr.for <- function() {
  for (i in seq(from= 1, to=length(corpus), by=1)){
    DublinCore(corpus[[i]], "title") = LETTERS[round(runif(26))]
    DublinCore(corpus[[i]], "Publisher" ) = LETTERS[round(runif(26))]
  }
}

microbenchmark(expr.for())
# Unit: milliseconds
#         expr      min       lq   median       uq      max
# 1 expr.for() 21.50504 22.40111 23.56246 23.90446 70.12398

使用tm_map

corpus <- crude

expr.map <- function() {
  tm_map(corpus, function(x) {
    meta(x, "title") = LETTERS[round(runif(26))]
    meta(x, "Publisher" ) = LETTERS[round(runif(26))]
    x
  })
}

microbenchmark(expr.map())
# Unit: milliseconds
#         expr      min       lq   median       uq      max
# 1 expr.map() 5.575842 5.700616 5.796284 5.886589 8.753482

所以tm_map版本,正如您所注意到的,似乎快了大约4倍。

在您的问题中,您说tm_map版本中的更改不是持久的,这是因为您不会在匿名函数结束时返回x。最后它应该是:

meta(x, tag = "Heading") = csv[[i,10]]  
meta(x, tag = "publisher" ) = csv[[i,16]] 
x