Question

我写了一个简单的函数：

myfunction <- function(fileName, stringsAsFactors=TRUE,                 
                   check.names=FALSE,               
                   skip =1,...) {
Data <- read.delim(fileName, skip = skip,                     
                 stringsAsFactors=stringsAsFactors,                      
                 check.names = check.names, ...)                   
cb    <- list()                       
Index <- as.numeric(as.factor(Data[,1]))              
cb    <-  cbind(Data, Index)              
return(cb)

}

此函数获取名为Data的文件的第一列，根据该第一列创建一个Index，然后cbind文件Data和创建的索引。此函数将应用于名为myfile_00.txt，myfile_01.txt等文件中。对于单个文件，它看起来像：

myfunction (fileName = "myfile_00.txt")
myfunction (fileName = "myfile_01.txt")
.......

我有大约1000个文件，所以我想，循环可以来自另一个帖子：

mytxt  <- dir(pattern=".txt")      
n      <- length(mytxt)      
mylist <- vector("list", n)   
for(i in 1:n) {
    mylist[[i]] <- read.delim(mytxt[i], header = F, skip = 1)
}

然后：

d <- lapply(mylist, myfunction)

不幸的是它不起作用......当使用lapply时会发生错误：

Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote,  : 
'file' must be a character string or connection

因为我是R的新人，我可能会犯错误，我无法弄明白。有人可以帮帮我吗？

最好，

F。

Answer 1

就像@Arun指出的那样，你试图运行你的函数两次：一次是在文件上，一次是你创建的数据框......相反，你的代码应该是这样的：

files <- list.files(pattern = ".txt")
mylist <- lapply(files, myfunction)

在多个文件上循环一个函数

1 个答案: