Matlab图像绘制纳米值

Question

当使用imagesc可视化包含NaN值的数据时，Matlab将它们视为最小值（灰色表示它们是黑色，喷射蓝色等）。 jet colormap既不包含黑色也不包含白色。是否可以将nan值显示为黑/白？ 例如：

data = [0 0 0 ; .5 .5 .5 ;1 1 1;nan nan nan];

应该产生蓝绿红黑条。

由于

Answer 1

我编写了一个自定义函数，将NaN值显示为透明，即alpha值为0.

function h = imagesc2 ( img_data )
% a wrapper for imagesc, with some formatting going on for nans

% plotting data. Removing and scaling axes (this is for image plotting)
h = imagesc(img_data);
axis image off

% setting alpha values
if ndims( img_data ) == 2
  set(h, 'AlphaData', ~isnan(img_data))
elseif ndims( img_data ) == 3
  set(h, 'AlphaData', ~isnan(img_data(:, :, 1)))
end

if nargout < 1
  clear h
end

NaN因此将显示与图形背景颜色相同的颜色。如果删除行axis image off，则NaN将显示与轴背景颜色相同的颜色。该函数假定输入图像的大小为n x m（单通道）或n x m x 3（三个通道），因此根据您的使用情况可能需要进行一些修改。

使用您的数据：

data = [0 0 0 ; .5 .5 .5 ;1 1 1;nan nan nan];
imagesc2(data);
axis on
set(gca, 'Color', [0, 0, 0])

Answer 2

function imagescnan(IM)
% function imagescnan(IM)
% -- to display NaNs in imagesc as white/black

% white
nanjet = [ 1,1,1; jet  ];
nanjetLen = length(nanjet); 
pctDataSlotStart = 2/nanjetLen;
pctDataSlotEnd   = 1;
pctCmRange = pctDataSlotEnd - pctDataSlotStart;

dmin = nanmin(IM(:));
dmax = nanmax(IM(:));
dRange = dmax - dmin;   % data range, excluding NaN

cLimRange = dRange / pctCmRange;
cmin = dmin - (pctDataSlotStart * cLimRange);
cmax = dmax;
imagesc(IM);
set(gcf,'colormap',nanjet);
caxis([cmin cmax]);

Answer 3

我可以看到两种可能的方法来实现这一目标：

a）修改jet colormap，使其最小值为黑色或白色，例如：

cmap = jet;
cmap = [ 0 0 0 ; cmap ];  % Add black as the first color

缺点是，如果您使用此色彩图显示没有nan值的数据，则最小值也会以黑/白显示。

b）使用文件交换中的sc，将imagesc绘图呈现为RGB图像。这更灵活，因为一旦你拥有RGB图像，你可以随意操纵它，包括改变所有nan值。 e.g：

im = sc(myData);
im(repmat(isnan(myData), [ 1 1 3 ]) ) = 0;  % Set all the nan values in all three 
                                            % color channels to zero (i.e. black)