Question

我的数据如下：

> sq1
foofoofoobar
foofoofoo
> sq2
quxquxquxbar
quxquxquxbar
quxx
> sq3
foofoofoobar
foofoofoo
> sq4
foofoofoobar
foofoo

我想在“＆gt; sqi”标题的基础上加入这些行作为截止行，即屈服：

foofoofoobarfoofoofoo
quxquxquxbarquxquxquxbarquxx
foofoofoobarfoofoofoo
foofoofoobarfoofoo

我尝试使用此sed但失败了：

sed '/^S/d;N;s/\n/\t/'

这样做的正确方法是什么？

Answer 1

#!/bin/sed -f

# If this is a header line, empty it...
s/^>.*//
# ... and then jump to the 'end' label.
t end
# Otherwise, append this data line to the hold space.
H
# If this is not the last line, continue to the next line.
$!d
# Otherwise, this is the end of the file or the start of a header.
: end
# Call up the data lines we last saw (putting the empty line in the hold).
x
# If we haven't seen any data lines recently, continue to the next line.
/^$/d
# Otherwise, strip the newlines and print.
s/\n//g

# The one-line version:
# sed -e 's/^>.*//;te' -e 'H;$!d;:e' -e 'x;/^$/d;s/\n//g'

Answer 2

你在线的开头测试一个大写字母“S”。你应该测试大于号的字符：

sed '/^>/d;N;s/\n/\t/'

或

sed '/^> sq/d;N;s/\n/\t/'

编辑：我错过了标题之间有可变行数的事实。这就是我到目前为止所做的：

sed  -n '/^>/{x; p; d}; /^>/!H; x; s/\n/\t/; h; $p'

不幸的是，这留在标题中：

> sq1    foofoofoobar    foofoofoo
> sq2    quxquxquxbar    quxquxquxbar    quxx
> sq3    foofoofoobar    foofoofoo
> sq4    foofoofoobar    foofoo

如果您从Bash提示符执行此操作，则可能必须先执行set +H，以免由于感叹号而导致历史记录扩展干扰。

Edit2 ：我修改后的版本摆脱了标题：

sed  -n '1{x;d};/^>/{x; p; d}; H; x; s/\n/\t/; s/^>.*\t//; h; $p'

Answer 3

原始问题的bash解决方案（即没有“标题”）：

#!/bin/bash
text=[]
i=0

exec <$1

while read line
do
    text[$i]=$line
    let "i += 1"
done


j=0
len=0
while [ $j -lt ${#text[@]} ]
do
    string=${text[$j]}
    if [ $len -le ${#string} ] ; then
        printf $string
    else
        printf $string'\n'
    fi
    len=${#string}
    let "j += 1"
done
printf '\n'

Answer 4

我找不到一种简单的方法在sed中做到这一点。无论如何，有了gawk / mawk，你只需要改变 RS变量和剪切换行符：

awk -v RS='> sq[0-9]' 'NR>1{gsub(/\n/,"");print}' file

在SED中加入符合条件的换行符

4 个答案: