Question

我最近在ubuntu机器上安装了 hdf5 库，现在无法链接到导出的函数。我写了一个简单的测试脚本 readHDF.cpp 来解释这个问题：

#include <hdf5.h>

int main(int argc, char * argv[])
{
  hid_t     h5_file_id = H5Fopen(argv[1], H5F_ACC_RDWR, H5P_DEFAULT);
  return 0;
}

编译命令是

g++ -Wl,-rpath,$HOME/hdf5/lib -I$HOME/hdf5/include \
    -L$HOME/hdf5/lib -l:$HOME/hdf5/lib/libhdf5.so readHDF.cpp

返回以下错误

/tmp/cc6DXdxV.o: In function `main':  
readHDF.cpp:(.text+0x1f): undefined reference to `H5check_version'  
readHDF.cpp:(.text+0x3c): undefined reference to `H5Fopen'  
collect2: ld returned 1 exit status

我感到困惑，因为 nm 命令似乎表示该函数已导出：

nm -C $HOME/hdf5/lib/libhdf5.so | grep H5check_version

返回

0000000000034349 T H5check_version

和H5Fopen的类似结果。什么可能出错？不确定它是否有帮助，但如果我注释掉脚本的H5Fopen部分，那么它编译得很好：

#include <hdf5.h>

int main(int argc, char * argv[])
{
hid_t     h5_file_id;// = H5Fopen(argv[1], H5F_ACC_RDWR, H5P_DEFAULT);
return 0;
}

此外，服务器上安装了多个版本的hdf5，它们被各种python模块（如h5py和table）使用，但我无法使其中任何一个工作，所以我在本地目录中安装了此版本并更改了g ++链接器的rpath选项。

Answer 1

好的，解决了。问题在于在编译命令中放置-lhdf5。显然-lhdf5应该放在readHDF.cpp之后。例如，g++ -Wl,-rpath=$HOME/hdf5/lib -L$HOME/hdf5/lib -I$HOME/hdf5/include readHDF.cpp -lhdf5将编译没有问题，但g++ -Wl,-rpath=$HOME/hdf5/lib -L$HOME/hdf5/lib -I$HOME/hdf5/include -lhdf5 readHDF.cpp将失败，未定义的引用错误。有趣的是，这只是Ubuntu 12.04的一个问题，因为两个编译命令都适用于Ubuntu 10.04。

在这篇文章中找到答案并解释：

undefined reference to symbol even when nm indicates that this symbol is present

我想在脚本之后放置-lXXX是更安全的做法。

Answer 2

这不是错误。看到 C++ shared library undefined reference to `FooClass::SayHello()'

＆＃34; GCC的最新版本要求您将目标文件和库按照它们相互依赖的顺序放置......＆＃34;

Answer 3

您忘记将-lhdf5放入编译命令中。此外，不需要-l:$HOME/hdf5/lib/libhdf5.so

这应该有效：$ g++ -Wl,-rpath,$HOME/hdf5/lib -I$HOME/hdf5/include -L$HOME/hdf5/lib -lhdf5 readHDF5.cpp

g ++编译错误：对存在的共享库函数的未定义引用

3 个答案: