返回数组中子数组的索引

时间:2013-02-15 07:45:42

标签: python arrays numpy

我使用Python numpy

我有一个numpy数组may_a

may_a = numpy.array([False, True, False, True, True, False, True, False, True, True, False])

我有一个numpy数组may_b

may_b = numpy.array([False,True,True,False])

我需要在数组may_b中找到数组may_a

在输出中我需要获取出现的索引。

out_index=[2,7]

有人可以建议,如何获得out_index

5 个答案:

答案 0 :(得分:5)

更酷的方法,可能效果不好,但适用于任何dtype,是使用as_strided

In [2]: from numpy.lib.stride_tricks import as_strided

In [3]: may_a = numpy.array([False, True, False, True, True, False,
   ...:                      True, False, True, True, False])

In [4]: may_b = numpy.array([False,True,True,False])

In [5]: a = len(may_a)

In [6]: b = len(may_b)

In [7]: a_view = as_strided(may_a, shape=(a - b + 1, b),
   ...:                     strides=(may_a.dtype.itemsize,) * 2)

In [8]: a_view
Out[8]: 
array([[False,  True, False,  True],
       [ True, False,  True,  True],
       [False,  True,  True, False],
       [ True,  True, False,  True],
       [ True, False,  True, False],
       [False,  True, False,  True],
       [ True, False,  True,  True],
       [False,  True,  True, False]], dtype=bool)

In [9]: numpy.where(numpy.all(a_view == may_b, axis=1))[0]
Out[9]: array([2, 7])

你必须要小心,因为尽管a_viewmay_a数据的视图,但在将其与may_b进行比较时,(a - b + 1) * b的临时数组是已创建,这可能是大ab s。

的问题

答案 1 :(得分:4)

编辑以下代码允许执行基于卷积的相等检查。它将True映射到1False映射到-1。它还会反转b,这是正常工作所必需的:

def search(a, b) :
    return np.where(np.round(fftconvolve(a * 2 - 1, (b * 2 - 1)[::-1],
                                         mode='valid') - len(b)) == 0)[0]

我已经检查过,它为各种随机输入提供了与as_strided方法相同的输出。我也有时间接近,并且卷积只开始用大约256件物品的大量搜索令牌付出代价。


看起来有点矫枉过正,但使用布尔数据你可以使用(滥用?)卷积:

In [8]: np.where(np.convolve(may_a, may_b.astype(int),
   ...:                      mode='valid') == may_b.sum())[0]
Out[8]: array([2, 7])

对于较大的数据集,使用scipy.signal.fftconvolve可能会更快:

In [13]: np.where(scipy.signal.fftconvolve(may_a, may_b,
   ....:                                   mode='valid') == may_b.sum())[0]
Out[13]: array([2, 7])

你必须小心,因为输出现在是浮点数,舍入可能会破坏相等检查:

In [14]: scipy.signal.fftconvolve(may_a, may_b, mode='valid')
Out[14]: array([ 1.,  1.,  2.,  1.,  1.,  1.,  1.,  2.])

所以你可能会对以下内容更好:

In [15]: np.where(np.round(scipy.signal.fftconvolve(may_a, may_b, mode='valid') -
   ....:                   may_b.sum()) == 0)[0]
Out[15]: array([2, 7])

答案 2 :(得分:3)

这与string search problem非常相似。如果你想避免实现这些字符串搜索算法,你可以通过执行以下操作来滥用字符串搜索中构建的pythons,这非常快:

# I've added [True, True, True] at the end.
may_a = numpy.array([False, True, False, True, True, False, True, False, True, True, False, True, True, True])
may_b = numpy.array([False,True,True,False])

may_a_str = may_a.tostring()
may_b_str = may_b.tostring()

idx = may_a_str.find(may_b_str)
out_index = []
while idx >= 0:
    out_index.append(idx)
    idx = may_a_str.find(may_b_str, idx+1)

这应该适用于布尔数组。如果你想将这种方法用于另一种数组类型,你需要确保两个数组的步幅匹配,并按该步长划分out_index。

您也可以使用regular expression module代替循环来进行字符串搜索。

答案 3 :(得分:2)

这也适用于其他布尔数据:

In [1]: import numpy as np

In [2]: a = np.array([False, True, False, True, True, False, True, False, True, True, False])

In [3]: b = np.array([False,True,True,False])

In [4]: def get_indices(a, b):
   ...:     window = len(b)
   ...:     shape = a.shape[:-1] + (a.shape[-1] - window + 1, window)
   ...:     strides = a.strides + (a.strides[-1],)
   ...:     w = np.lib.stride_tricks.as_strided(a, shape=shape, strides=strides)
   ...:     return np.where(np.all(np.equal(w,b),1) == True)[0]

In [5]: get_indices(a,b)
Out[5]: array([2, 7])

答案 4 :(得分:1)

我不确定numpy是否为此提供了一个功能。如果没有,这是一个解决方案:

import numpy

def searchListIndexs(array, target):
    ret = []
    iLimit = len(array)-len(target)+1
    jLimit = len(target)
    for i in range(iLimit):
        for j in range(jLimit):
            if array[i+j] != target[j]:
                break
        else:
            ret.append(i)
    return ret


may_a = numpy.array([False, True, False, True, True, False, True, False, True, True, False])
may_b = numpy.array([False,True,True,False])
out_index = searchListIndexs(may_a, may_b)
print out_index #If you are using Python 3, then use print(out_index) instead.