如何更新matplotlib hexbin图?

时间:2013-02-06 17:03:51

标签: python matplotlib gtk

我在matplotlib中嵌入了hexbin GTK.Window来绘制一些数据(x,y)。我希望plot在收到新数据时更新(通过UDP)。我虽然遇到了一些麻烦。

我可以通过几种不同的方式让它工作,但没有一种是“有效的”(含义 - 重绘plot花费的时间太长)。我看了here并试图在建议的答案之后对我的hexbin进行建模,但根本无法使其工作。我一直收到以下错误:

TypeError: 'PolyCollection' object is not iterable.

我猜测hexbins无法以与标准plots相同的方式更新。

示例代码:

class graph:
    def __init__(self):
        self.window = gtk.Window()
        self.figure = plt.figure()
        self.ax = self.figure.add_subplot(111)
        self.canvas = FigureCanvas(self.figure)
        self.window.add(self.canvas)

        self.graph = None

    def plot(self, xData, yData):
        if len(xData) > 1 and len(yData) > 1:
            self.graph, = self.ax.hexbin(self.xData, self.yData) 
            ###############################################
            ####This is where the code throws the error####

    def update(self, xData, yData):
        self.graph.set_xdata(np.append(self.graph.get_xdata(), xData))
        self.graph.set_ydata(np.append(self.graph.get_ydata(), yData))
        self.figure.canvas.draw()

代码的使用方式如下:

graph = graph()
graph.plot(someXData, someYData)
# when new data is received
graph.update(newXData, newYData)

这只是我如何使用代码的一个很小的例子。我对matplotlib没有多少经验,所以我有可能完全错误地解决这个问题。 (这很可能就是我在做什么)

所以我的最终问题是 - 你如何更新matplotlib hexbin情节?


编辑:感谢danodonovan的回答,我修改了我的代码并在self.graph = self.ax.hexbin(...)之后删除了','

抛出的新错误是:AttributeError: 'PolyCollection' object has no attribute 'set_xdata'

3 个答案:

答案 0 :(得分:2)

该行:

 self.graph, = self.ax.hexbin(self.xData, self.yData)

(如果这是你的堆栈跟踪抛出异常的地方)将是因为逗号,暗示self.ax.hexbin是一个可迭代对象。改为

 self.graph = self.ax.hexbin(self.xData, self.yData)

可能会停止TypeError exception。下一次,在堆栈跟踪中提供更多行 - 这可能有助于澄清事情。

答案 1 :(得分:2)

我认为目前无法做到这一点,hexbin转换x,y - >列表多边形的集合。 polyCollection只是一个顶点,边和面颜色的列表,我认为它不包含任何关于它是如何生成的语义信息。

最好的方法是核旧hexbin并用新的替换它。

如果您真的希望能够就地更新,请使用方形2d直方图(这样您可以使用imshow),或者您可以修改hexbin以返回补丁列表(而不是一个polyCollection)并跟踪你自己的分档。

答案 2 :(得分:0)

要回答您的预期问题,请尝试set_xdata之类的问题,而不是致电update_from。我不承诺这会起作用,但我会尝试

def update(self, xData, yData):
    # update your data structures
    self.xData = np.append(self.xData, xData)
    self.yData = np.append(self.yData, yData)

    # create a new hexbin - not connected to anything, with the new data
    new_hexbin = self.ax.hexbin(self.xData, self.yData)

    # update the viewed hexbin from the new one
    self.graph.update_from(new_hexbin)
    self.figure.canvas.draw()

请注意,如果没有更多代码或解释,这只是猜测工作!此课程的文档为hereupdate_from方法来自parent class